Transcriptomic data of imbibed wheat (Triticum aestivum L.) seeds developed at different temperatures
Notice bibliographique
Résumé
The present data profiles a large scale transcriptome changes associated with variations in seed dormancy level induced by seed development temperature in hexaploid wheat. Seed dormancy is an important trait that inhibits seed germination under optimal conditions and therefore has important implication in preventing the incidence of preharvest sprouting, which refers to the germination of seeds on the mother plant prior to harvest, in wheat. Since the incidence of preharvest sprouting, which causes a significant reduction in seed yield and quality in wheat, is closely associated with low level of seed dormancy manifested in modern wheat cultivars, it is important to develop wheat cultivars with optimal level of dormancy to enhance wheat yield and quality. Thus, elucidation of the molecular mechanisms that regulate seed dormancy is critical for the development of pre-harvest sprouting resistant wheat cultivars. The data we are presenting here was generated from total RNA samples extracted from imbibed seeds of a dormant wheat (Triticum aestivum L.) genotype that were developed at different temperatures using the Affymetrix GeneChip Wheat Genome Array. The raw and normalized formats of these data are deposited in the NCBI's gene expression data repository, Gene Expression Ominbus (GEO)r with accession number GSE153527.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».