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Enregistrement W4386400752 · doi:10.1101/2023.08.31.23294915

Discovery of 95 PTSD loci provides insight into genetic architecture and neurobiology of trauma and stress-related disorders

2023· preprint· en· W4386400752 sur OpenAlexaff
Caroline M. Nievergelt, Adam X. Maihofer, Elizabeth G. Atkinson, Chia‐Yen Chen, Karmel W. Choi, Jonathan R. I. Coleman, Nikolaos P. Daskalakis, Laramie E. Duncan, Renato Polimanti, Cindy Aaronson, Ananda B. Amstadter, Søren Bo Andersen, Ole A. Andreassen, Paul A. Arbisi, Allison E. Ashley‐Koch, S. Bryn Austin, Esmina Avdibegović, Dragan Babić, Silviu‐Alin Bacanu, Dewleen G. Baker, Anthony Batzler, Jean C. Beckham, Síntia Belangero, Corina Benjet, Carisa Bergner, Linda M. Bierer, Joanna M. Biernacka, Laura J. Bierut, Jonathan I. Bisson, Marco P. Boks, Elizabeth Bolger, Amber Brandolino, Gerome Breen, Rodrigo A. Bressan, Richard A. Bryant, Angela C. Bustamante, Jonas Bybjerg‐Grauholm, Marie Bækvad‐Hansen, Anders D. Børglum, Sigrid Børte, Leah Cahn, Joseph R. Calabrese, José Miguel Caldas‐de‐Almeida, Chris Chatzinakos, Sheraz Cheema, Sean Clouston, Lucía Colodro‐Conde, Brandon J. Coombes, Carlos Cruz-Fuentes, Anders M. Dale, Shareefa Dalvie, Lea K. Davis, Jürgen Deckert, Douglas L. Delahanty, Michelle F. Dennis, Terri A. deRoon‐Cassini, Frank Désarnaud, Christopher P. DiPietro, Seth G. Disner, Anna R. Docherty, Katharina Domschke, Grete Dyb, Alma Džubur Kulenović, Howard J. Edenberg, Alexandra Evans, Chiara Fabbri, Negar Fani, Lindsay A. Farrer, Adriana Feder, Norah C. Feeny, Janine D. Flory, David Forbes, Carol E. Franz, Sandro Galea, Melanie E. Garrett, Bizu Gelaye, Joel Gelernter, Elbert Geuze, Charles F. Gillespie, Afërdita Goçi, Slavina B. Goleva, Scott D. Gordon, Lana Ruvolo Grasser, Camila Guindalini, Magali Haas, Saskia P. Hagenaars, Michael A. Hauser, Andrew C. Heath, Sian MJ Hemmings, Victor Hesselbrock, Ian B. Hickie, Kelleigh Hogan, David M. Hougaard, Hailiang Huang, Laura M. Huckins, Kristian Hveem, Miro Jakovljević, Arash Javanbakht, Gregory D. Jenkins, Jessica Johnson, Ian Jones, Tanja Jovanović, Karen‐Inge Karstoft, Milissa L. Kaufman, James L. Kennedy, Ronald C. Kessler, Nathan A. Kimbrel, Anthony P. King, Nastassja Koen, Roman Kotov, Henry R. Kranzler, Kristi Krebs, William S. Kremen, Pei Fen Kuan, Bruce R. Lawford, Lauren A. M. Lebois, Kelli Lehto, Daniel Levey, Cathryn M. Lewis, Israel Liberzon, Sarah D. Linnstaedt, Mark W Logue, Adriana Lori, Yi Lu, Benjamin J. Luft, Michelle K. Lupton, Jurjen J. Luykx, Iouri Makotkine, Jessica L. Maples‐Keller, Shelby Marchese, Charles R. Marmar, Nicholas G. Martin, Gabriela Ariadna Martínez-Levy, Kerrie McAloney, Alexander C. McFarlane, Katie A. McLaughlin, Samuel A. McLean, Sarah E. Medland, Divya Mehta, Jacquelyn L. Meyers, Vasiliki Michopoulos, Elizabeth A. Mikita, Lili Milani, William Milberg, Mark W. Miller, Rajendra A. Morey, C. Phillip Morris, Ole Mors, Preben Bo Mortensen, Mary S. Mufford, Elliot C. Nelson, Merete Nordentoft, Sonya B. Norman, Nicole R. Nugent, Meaghan O’Donnell, Holly K. Orcutt, Pedro Mário Pan, Matthew S. Panizzon, Gita A. Pathak, Edward Peters, Alan L. Peterson, Matthew Peverill, Robert H. Pietrzak, Melissa A. Polusny, Bernice Porjesz, Abigail Powers, Xuejun Qin, Andrew Ratanatharathorn, Victoria B. Risbrough, Andrea L. Roberts, Barbara O. Rothbaum, Alex O. Rothbaum, Peter Roy‐Byrne, Kenneth J. Ruggiero, Ariane L. Rung, Heiko Runz, Bart P. F. Rutten, Stacey Saenz de Viteri, Giovanni Abrahão Salum, Laura Sampson, Sixto E. Sánchez, Marcos Santoro, Carina Seah, Soraya Seedat, Julia S. Seng, Andrey A. Shabalin, Christina M. Sheerin, Derrick Silove, Alicia K. Smith, Jordan W. Smoller, Scott R. Sponheim, Dan J. Stein, Synne Øien Stensland, Jennifer S. Stevens, Jennifer A. Sumner, Martin H. Teicher, Wesley K. Thompson, Arun K. Tiwari, Edward Trapido, Monica Uddin, Robert J. Ursano, Unnur Valdimarsdóttir, Leigh L. van den Heuvel, Miranda Van Hooff, Sanne J.H. van Rooij, Eric Vermetten, Christiaan H. Vinkers, Joanne Voisey, Zhewu Wang, Yunpeng Wang, Monika A. Waszczuk, Heike Weber, Frank R. Wendt, Thomas Werge, Michelle A. Williams, Douglas E. Williamson, Bendik S. Winsvold, Sherry Winternitz, Erika J. Wolf, Christiane Wolf, Yan Xia, Xiong Ying, Rachel Yehuda, Ross McD. Young, Clement C. Zai, Gwyneth Zai, Mark Zervas, Hongyu Zhao, Lori A. Zoellner, John‐Anker Zwart, Murray B. Stein, Kerry J. Ressler, Karestan C. Koenen

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueStress Responses and Cortisol
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNIHR Maudsley Biomedical Research CentreNational Institute of Mental HealthInstitute of Psychiatry, Psychology and Neuroscience, King’s College LondonStanley Center for Psychiatric Research, Broad InstituteUniversity of California, San DiegoUniversitetet i OsloBiogenCohen Veterans BioscienceCenter of Excellence for Stress and Mental HealthMcLean HospitalBroad InstituteUniversity of MinnesotaKing's College LondonYale UniversityVeterans Affairs San Diego Healthcare SystemSouth London and Maudsley NHS Foundation TrustNational Institute for Health and Care ResearchMassachusetts General HospitalHarvard T.H. Chan School of Public HealthU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésGenome-wide association studyNeuroscienceGenetic architectureBiologyGenetic associationGeneFight-or-flight responseGeneticsPsychologySingle-nucleotide polymorphismQuantitative trait locus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Posttraumatic stress disorder (PTSD) genetics are characterized by lower discoverability than most other psychiatric disorders. The contribution to biological understanding from previous genetic studies has thus been limited. We performed a multi-ancestry meta-analysis of genome-wide association studies across 1,222,882 individuals of European ancestry (137,136 cases) and 58,051 admixed individuals with African and Native American ancestry (13,624 cases). We identified 95 genome-wide significant loci (80 novel). Convergent multi-omic approaches identified 43 potential causal genes, broadly classified as neurotransmitter and ion channel synaptic modulators (e.g., GRIA1, GRM8, CACNA1E ), developmental, axon guidance, and transcription factors (e.g., FOXP2, EFNA5, DCC ), synaptic structure and function genes (e.g., PCLO, NCAM1, PDE4B ), and endocrine or immune regulators (e.g., ESR1, TRAF3, TANK ). Additional top genes influence stress, immune, fear, and threat-related processes, previously hypothesized to underlie PTSD neurobiology. These findings strengthen our understanding of neurobiological systems relevant to PTSD pathophysiology, while also opening new areas for investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,469
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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