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Enregistrement W4386433038 · doi:10.48130/frures-2023-0027

Genomic insights into apple aroma diversity

2023· article· en· W4386433038 sur OpenAlexaff
Tayab Soomro, Michael Jordan, Sophie Watts, Zoë Migicovsky, Charles F. Forney, Jun Song, Sean Myles

Notice bibliographique

RevueFruit Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePostharvest Quality and Shelf Life Management
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaDalhousie UniversityAcadia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAromaSingle-nucleotide polymorphismGenome-wide association studyHexanolFood scienceLocus (genetics)BiologyChemistryAlcoholGeneticsGeneBiochemistryGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An apple's aroma is a major determinant of its desirability by consumers. To better understand the aroma of apples, 2-dimensional gas-chromatography mass-spectrometry (2D-GCMS) was used to quantify 106 volatile organic compounds (VOCs) from 515 apple varieties. We identified esters and aldehydes as the most abundant classes of VOCs, with butyl acetate and hexyl acetate being present in nearly every variety. Principal component analysis (PCA) revealed that the primary axis of variation in the apple volatilome is correlated with harvest date, with early-harvested apples expressing a greater number and higher concentration of VOCs compared to late-harvested apples. Genome-wide association studies (GWAS) using 250,579 single nucleotide polymorphisms (SNPs) identified a significant association between SNPs near the alcohol acyltransferase (AAT1) locus and the abundance of several esters. Additionally, strong associations were observed between SNPs at the NAC18.1 transcription factor locus and the abundances of 1-hexanol and 1-butanol, which serve as precursors for hexyl acetate and butyl acetate, respectively. These findings provide a foundation for understanding the genetic basis of apple aroma production and pave the way for the genomics-assisted enhancement of the aroma profiles of apple varieties to meet consumer preferences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,198
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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