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Enregistrement W4386491872 · doi:10.2135/cropsci2002.2100a

Biplot Analysis of Diallel Data

2002· article· en· W4386491872 sur OpenAlexaff
Weikai Yan, L. A. Hunt

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetics and Plant Breeding
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiplotDiallel crossBiologyGenotypeBiotechnologyPrincipal component analysisHybridStatisticsGeneticsMathematicsAgronomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diallel crosses have been used in genetic research to determine the inheritance of important traits among a set of genotypes and to identify superior parents for hybrid or cultivar development. Conventional diallel analysis is limited to partitioning the total variation of the data into general combining ability (GCA) of each genotype and specific combining ability (SCA) of each cross. In this paper we formulate a biplot approach for graphical diallel analysis. The biplot is constructed by the first two principal components (PCs) derived from subjecting the tester‐centered diallel data to singular value decomposition. It displays the most important entry by tester patterns of the data and allows the following information to be extracted visually: (i) GCA of each genotype; (ii) SCA of each genotype; (iii) groups of parents with similar genetics; and (iv) superior hybrids. In addition, the biplot allows hypotheses to be formulated concerning the genetics of the genotypes. Three published diallel data sets of wheat (Triticum aestivum L.) and maize (Zea mays L.) were used to demonstrate the biplot approach and detailed procedures were provided for constructing and interpreting a biplot.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,179
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,073 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations88
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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