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Enregistrement W4386494159 · doi:10.1101/2023.09.06.556408

ATAD1 and the integrated stress response prevent clogging of TOM and damage caused by un-imported mitochondrial proteins

2023· preprint· en· W4386494159 sur OpenAlexafffund
J. Kim, Madeleine Goldstein, Lauren Zecchel, Hilla Weidberg

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésMitochondrionCell biologyTranslocaseBiologyMitochondrial membrane transport proteinOrganelleATP–ADP translocaseInner mitochondrial membraneMitochondrial carrierTransport proteinBacterial outer membraneBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mitochondria require the constant import of nuclear-encoded proteins for proper functioning. Impaired protein import not only depletes mitochondria of essential factors but also leads to toxic accumulation of un-imported proteins outside the organelle. Defects in mitochondrial protein import are associated with neurodegenerative and bioenergetic diseases. Here, we investigated the consequences of mitochondrial protein import stress in human cells. We demonstrated that un-imported proteins can clog the mitochondria by stalling inside the translocase of the outer membrane (TOM). We found that the integrated stress response (ISR) acted as the first line of defense to mitochondrial clogging by attenuating global protein translation and preventing excessive accumulation of un-imported proteins. A second mechanism, mediated by a mitochondrial ATPase, ATAD1, acted specifically to remove proteins from TOM and clear the entry gate into the mitochondria. ATAD1 interacted with both TOM and stalled proteins, and its knockout resulted in extensive accumulation of mitochondrial precursors as well as decreased protein import. Increased ATAD1 expression improved tolerance of cells to defective mitochondrial protein import, demonstrating the importance of this quality control pathway in surveilling protein import and its contribution to cellular health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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