MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4386505094 · doi:10.1242/dmm.049326

Loss of zebrafish <i>pkd1l1</i> causes biliary defects that have implications for biliary atresia splenic malformation

2023· article· en· W4386505094 sur OpenAlexafffund
R. Ali, Anne Meyer-Miner, Marie David-Rachel, F. Lee, Benjamin J. Wilkins, Saul J. Karpen, Brian Ciruna, Anand Ghanekar, Binita M. Kamath

Notice bibliographique

RevueDisease Models & Mechanisms · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePediatric Hepatobiliary Diseases and Treatments
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity Health NetworkUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesHospital for Sick ChildrenChildren's Hospital of PhiladelphiaCanada Research ChairsRare Disease FoundationChildren's Hospital FoundationCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Liver Foundation
Mots-clésBiliary atresiaZebrafishBiologyGallbladderAlagille syndromeMutantInternal medicineEndocrinologyGeneticsGeneMedicineCholestasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biliary atresia is a fibroinflammatory neonatal disease with no effective therapies. A subset of cases (10-20%) is associated with laterality defects - labeled biliary atresia splenic malformation (BASM) syndrome. Recently, whole-exome sequencing of patients with BASM identified deleterious variants in PKD1L1. PKD1L1 is involved in left-right axis determination; however, its role in cholangiocytes is unknown. We generated the pkd1l1hsc117 allele using CRISPR/Cas9 mutagenesis in zebrafish to determine the role of Pkd1l1 in biliary development and function. Wild-type and mutant larvae were assessed for laterality defects, biliary function and biliary tree architecture at 5 days post fertilization. pkd1l1hsc117 mutant larvae exhibited early left-right patterning defects. The gallbladder was positioned on the left in 47% of mutants compared to 4% of wild-type larvae. Accumulation of PED6 in the gallbladder, an indicator of hepatobiliary function, was significantly reduced in pkd1l1hsc117 mutants (46%) compared to wild-type larvae (4%). pkd1l1hsc117 larvae exhibited fewer biliary epithelial cells and reduced density of the intrahepatic biliary network compared to those in wild-type larvae. These data highlight the essential role of pkd1l1 in normal development and function of the zebrafish biliary system, supporting a role for this gene as a cause of BASM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,418
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDisease Models & MechanismsMême sujetPediatric Hepatobiliary Diseases and TreatmentsTravaux en français237 207