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Enregistrement W4386514991 · doi:10.1101/2023.09.06.555321

Emergence of disease-specific endothelial and stromal cell populations responsible for arterial remodeling during development of pulmonary arterial hypertension

2023· preprint· en· W4386514991 sur OpenAlexafffund
Nicholas D Cober, Emma R. McCourt, Rafael Soares Godoy, Yupu Deng, Ken Schlosser, David P. Cook, Sarah‐Eve Lemay, Timothy Klouda, Ke Yuan, Sébastien Bonnet, Duncan J. Stewart

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePulmonary Hypertension Research and Treatments
Établissements canadiensInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecOttawa HospitalUniversité LavalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Vascular NetworkOttawa Hospital Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Ottawa
Mots-clésPopulationGene signatureMedicineAngiogenesisEndothelial stem cellStromal cellInternal medicinePathologyCardiologyBiologyGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pulmonary arterial hypertension (PAH) is a severe and lethal pulmonary vascular disease characterized by arteriolar pruning and occlusive vascular remodeling leading to increased pulmonary vascular resistance and eventually right heart failure. While endothelial cell (EC) injury and apoptosis are known triggers for this disease, the mechanisms by which they lead to complex arterial remodeling remain obscure. We employed multiplexed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) at multiple timepoints during the onset and progression of disease in a model of severe PAH to identify mechanisms involved in the development of occlusive arterial lesions. There was significant loss of arterial volume as early as 1-week by microCT, preceding any evidence of occlusive arteriopathy, consistent with early arteriolar dropout. Maximal arterial pruning was seen by 5 to 8 weeks, with signs of progressive occlusive remodeling. Analysis of the scRNA-seq data resolved 44 lung cell populations, with widespread early transcriptomic changes at 1 week affecting endothelial, stromal and immune cell populations. Notably, this included emergence of a relatively dedifferentiated (dD) EC population that was enriched for Cd74 expression compared to general capillary (gCap) ECs which were primed to undergo endothelial-mesenchymal transition, as evidenced by RNA velocity analysis. However, at late timepoints (5 and 8 weeks), activated arterial ECs (aAECs) were the only cell population exhibiting persistent differential gene expression. This was characterized by a growth regulated state, including high expression of Tm4sf1 , a gene implicated in cancer cell growth, which was also expressed by a smooth muscle (SM)-like pericyte cluster. Both these populations were localized to regions of arterial remodeling in the rat model and PAH patients, with aAECs contributing to intimal occlusive lesions and SM-like pericytes forming bands of medial muscularization. Together these findings implicate disease-specific vascular cells in PAH progression and suggest that TM4SF1 may be a novel therapeutic target for arterial remodeling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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