MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4386593320 · doi:10.1002/ijc.34710

Diagnostic accuracy of <scp>HPV16</scp> early antigen serology for <scp>HPV</scp>‐driven oropharyngeal cancer is independent of age and sex

2023· article· en· W4386593320 sur OpenAlexafffund
Johannes M A Kusters, Brenda Diergaarde, Maarten F. Schim van der Loeff, Janneke C. M. Heijne, Lea Schroeder, Katrina Hueniken, James McKay, Gary J. Macfarlane, Παγώνα Λάγιου, Areti Lagiou, Jerry Polesel, Antonio Agudo, Laia Alemany, Wolfgang Ahrens, Claire M. Healy, David I. Conway, Max Robinson, Cristina Canova, Ivana Holcátová, Lorenzo Richiardi, Ariana Znaor, Miranda Pring, Steve Thomas, D. Neil Hayes, Geoffrey Liu, Rayjean J. Hung, Paul Brennan, Andrew F. Olshan, Shama Virani, Tim Waterboer

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePublic Health OntarioUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Environmental Health SciencesNational Cancer InstituteProgramme Grants for Applied ResearchMedical Research CouncilCanadian Cancer Society Research InstituteNational Institutes of HealthUniversität BremenAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroCancer Research UKUniversity Hospitals Bristol NHS Foundation TrustPrincess Margaret Hospital FoundationWorld Health OrganizationEuropean CommissionUniversity of PittsburghNational Institute for Health and Care ResearchCompagnia di San PaoloCentre International de Recherche sur le CancerDivision of Cancer Prevention, National Cancer Institute
Mots-clésSerologyMedicineInternal medicineOncologyBiomarkerCancerAntigenHPV infectionStage (stratigraphy)ImmunologyCervical cancerAntibodyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A growing proportion of head and neck cancer (HNC), especially oropharyngeal cancer (OPC), is caused by human papillomavirus (HPV). There are several markers for HPV‐driven HNC, one being HPV early antigen serology. We aimed to investigate the diagnostic accuracy of HPV serology and its performance across patient characteristics. Data from the VOYAGER consortium was used, which comprises five studies on HNC from North America and Europe. Diagnostic accuracy, that is, sensitivity, specificity, Cohen's kappa and correctly classified proportions of HPV16 E6 serology, was assessed for OPC and other HNC using p16INK4a immunohistochemistry (p16), HPV in situ hybridization (ISH) and HPV PCR as reference methods. Stratified analyses were performed for variables including age, sex, smoking and alcohol use, to test the robustness of diagnostic accuracy. A risk‐factor analysis based on serology was conducted, comparing HPV‐driven to non‐HPV‐driven OPC. Overall, HPV serology had a sensitivity of 86.8% (95% CI 85.1‐88.3) and specificity of 91.2% (95% CI 88.6‐93.4) for HPV‐driven OPC using p16 as a reference method. In stratified analyses, diagnostic accuracy remained consistent across sex and different age groups. Sensitivity was lower for heavy smokers (77.7%), OPC without lymph node involvement (74.4%) and the ARCAGE study (66.7%), while specificity decreased for cases with <10 pack‐years (72.1%). The risk‐factor model included study, year of diagnosis, age, sex, BMI, alcohol use, pack‐years, TNM‐T and TNM‐N stage. HPV serology is a robust biomarker for HPV‐driven OPC, and its diagnostic accuracy is independent of age and sex. Future research is suggested on the influence of smoking on HPV antibody levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of CancerMême sujetHead and Neck Cancer StudiesTravaux en français237 207