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Enregistrement W4386600565 · doi:10.21203/rs.3.rs-3328935/v1

Protocol for Metadata and Image Collection at Diabetic Foot Ulcer Clinics: Enabling Research in Wound Analytics and Deep Learning

2023· preprint· en· W4386600565 sur OpenAlexafffund
Reza Basiri, Karim Manji, Philip M. LeLievre, John M. Toole, Faith Kim, Shehroz S. Khan, Miloš R. Popović

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiabetic Foot Ulcer Assessment and Management
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of CalgaryToronto Rehabilitation InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity Health Network FoundationAlberta Health Services
Mots-clésMetadataSegmentationDeep learningAnalyticsExtractorArtificial intelligenceProtocol (science)Computer scienceMedicineDiabetic foot ulcerMachine learningJaccard indexDiabetic footDiabetes mellitusData scienceCluster analysisEngineeringWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: The escalating impact of diabetes and its complications, including diabetic foot ulcers (DFUs), presents global challenges in quality of life, economics, and resources, affecting around half a billion people. DFU healing is hindered by hyperglycemia-related issues and diverse diabetes-related physiological changes, necessitating ongoing personalized care. Artificial intelligence and clinical research strive to address these challenges by facilitating early detection and efficient treatments despite resource constraints. This study establishes a standardized framework for DFU data collection, introducing a dedicated case report form and a comprehensive dataset named Zivot. Results: Following this protocol, we created the Zivot dataset consisting of 269 patients with active DFUs, and about 3,700 RGB images and corresponding thermal and depth maps for the DFUs. The effectiveness of collecting a consistent and clean dataset was demonstrated using a bounding box prediction deep learning network that was constructed with EfficientNet as the feature extractor and UNet architecture. The network was trained on the Zivot dataset and the evaluation metrics showed promising values of 0.79 and 0.86 for F1-score and mAP segmentation metrics. Conclusions: This work and the Zivot database offer a foundation for further exploration of holistic and multi-modal approaches to DFU research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,055
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,135
Score d'incertitude au seuil0,451

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,055
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1350,059

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,263
Tête enseignante GPT0,525
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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