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Enregistrement W4386644935 · doi:10.3390/cancers15184526

Identifying New Contributors to Brain Metastasis in Lung Adenocarcinoma: A Transcriptomic Meta-Analysis

2023· article· en· W4386644935 sur OpenAlexafffund
Vanessa G. P. Souza, Aisling Forder, Nikita Telkar, Greg L. Stewart, Robson Francisco Carvalho, Luis A. J. Mur, Wan L. Lam, Patrícia P. Reis

Notice bibliographique

RevueCancers · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBrain Metastases and Treatment
Établissements canadiensBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésBrain metastasisTranscriptomeAdenocarcinomaCancer researchMetastasisMicroarrayBiologyLungImmune systemGeneMedicineBioinformaticsGene expressionImmunologyCancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lung tumors frequently metastasize to the brain. Brain metastasis (BM) is common in advanced cases, and a major cause of patient morbidity and mortality. The precise molecular mechanisms governing BM are still unclear, in part attributed to the rarity of BM specimens. In this work, we compile a unique transcriptomic dataset encompassing RNA-seq, microarray, and single-cell analyses from BM samples obtained from patients with lung adenocarcinoma (LUAD). By integrating this comprehensive dataset, we aimed to enhance understanding of the molecular landscape of BM, thereby facilitating the identification of novel and efficient treatment strategies. We identified 102 genes with significantly deregulated expression levels in BM tissues, and discovered transcriptional alterations affecting the key driver ‘hub’ genes CD69 (a type II C-lectin receptor) and GZMA (Granzyme A), indicating an important role of the immune system in the development of BM from primary LUAD. Our study demonstrated a BM-specific gene expression pattern and revealed the presence of dendritic cells and neutrophils in BM, suggesting an immunosuppressive tumor microenvironment. These findings highlight key drivers of LUAD-BM that may yield therapeutic targets to improve patient outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,171
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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