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Enregistrement W4386646830 · doi:10.1016/j.jgar.2023.08.022

In vitro activity of ceftazidime-avibactam against clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa from sub-Saharan Africa: ATLAS Global Surveillance Program 2017–2021

2023· article· en· W4386646830 sur OpenAlexaff
Mark G. Wise, James A. Karlowsky, Meredith Hackel, Mohamed Amine Harti, Bontle M.E. Ntshole, Eva Njeri Njagua, Rita Oladele, Catherine Samuel, Shameema Khan, Jeannette Wadula, Warren Lowman, Busisani W. Lembede, Daniel F. Sahm

Notice bibliographique

RevueJournal of Global Antimicrobial Resistance · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesPfizer
Mots-clésCeftazidime/avibactamKlebsiella pneumoniaeAvibactamCeftazidimeMicrobiologyBroth microdilutionBiologyPseudomonas aeruginosaAntimicrobialMinimum inhibitory concentrationBacteriaEscherichia coliGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To report the in vitro susceptibility of Enterobacterales (n = 3905) and Pseudomonas aeruginosa (n = 1,109) isolates, collected from patients in sub-Saharan Africa (four countries) in 2017–2021, to a panel of 10 antimicrobial agents with a focus on ceftazidime-avibactam activity against resistant phenotypes and β-lactamase carriers. MICs were determined by CLSI broth microdilution and interpreted using both 2022 CLSI and EUCAST breakpoints. β-lactamase genes were identified in select β-lactam-nonsusceptible isolate subsets using multiplex PCR assays. Among Enterobacterales, 96.2% of all isolates were ceftazidime-avibactam-susceptible (MIC90, 0.5 µg/mL), including all serine carbapenemase-positive (n = 127), 99.6% of ESBL-positive, carbapenemase-negative (n = 730), 91.9% of multidrug resistant (MDR; n = 1817), and 42.7% of DTR (difficult-to-treat resistance; n = 171) isolates. Metallo-β-lactamase (MBL) genes were identified in most (n = 136; 91.2%) ceftazidime-avibactam-resistant isolates (3.5% of all Enterobacterales isolates). Ceftazidime-avibactam percent susceptible values ranged from 99.5% (Klebsiella species other than Klebsiella pneumoniae) to 92.5% (K. pneumoniae) for the various Enterobacterial taxa examined. Greater than 90% of Enterobacterales isolates from each country (Cameroon, Ivory Coast, Nigeria, South Africa) were ceftazidime-avibactam-susceptible. Among P. aeruginosa, 88.9% of all isolates were ceftazidime-avibactam-susceptible (MIC90, 16 µg/mL). Most (88.5%) MBL-negative, meropenem-resistant (n = 78), 68.1% of MDR (n = 385), and 19.2% of DTR isolates (n = 99) were ceftazidime-avibactam-susceptible. MBL genes were identified in 43.1% of ceftazidime-avibactam-resistant isolates (n = 53; 4.8% of all P. aeruginosa isolates). Country-specific ceftazidime-avibactam percent susceptible values for P. aeruginosa ranged from 94.1% (Cameroon) to 76.2% (Nigeria). Reference in vitro antimicrobial susceptibility testing demonstrated that most recent Enterobacterales (96%) and P. aeruginosa (89%) clinical isolates from four sub-Saharan African countries were ceftazidime-avibactam susceptible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,550
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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