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Enregistrement W4386695379 · doi:10.1242/jcs.260644

Loss of ATG4B and ATG4A results in two-stage cell cycle defects in pancreatic ductal adenocarcinoma cells

2023· article· en· W4386695379 sur OpenAlexafffund
Paalini Sathiyaseelan, Suganthi Chittaranjan, Steve E. Kalloger, Jennifer A. Chan, Nancy E. Go, Mario A. Jardon, Cally J. Ho, Theodore Hui, Jing Xu, Christine Chow, Dongxia Gao, Fraser Johnson, William W. Lockwood, Gregg B. Morin, Daniel J. Renouf, David F. Schaeffer, Sharon M. Gorski

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensVancouver General HospitalCentre for Advancing Health OutcomesPancreas Centre (Canada)University of British ColumbiaCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreSimon Fraser University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBC Cancer FoundationPancreatic Cancer Action Network
Mots-clésBiologyCancer researchAutophagyCell cycleCell growthApoptosisInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) exhibits elevated levels of autophagy, which promote tumor progression and treatment resistance. ATG4B is an autophagy-related cysteine protease under consideration as a potential therapeutic target, but it is largely unexplored in PDAC. Here, we investigated the clinical and functional relevance of ATG4B expression in PDAC. Using two PDAC patient cohorts, we found that low ATG4B mRNA or protein expression is associated with worse patient survival outcomes, poorly differentiated PDAC tumors and a lack of survival benefit from adjuvant chemotherapy. In PDAC cell lines, ATG4B knockout reduced proliferation, abolished processing of LC3B (also known as MAP1LC3B), and reduced GABARAP and GABARAPL1 levels, but increased ATG4A levels. ATG4B and ATG4A double knockout lines displayed a further reduction in proliferation, characterized by delays in G1-S phase transition and mitosis. Pro-LC3B accumulated aberrantly at the centrosome with a concomitant increase in centrosomal proteins PCM1 and CEP131, which was rescued by exogenous ATG4B. The two-stage cell cycle defects following ATG4B and ATG4A loss have important therapeutic implications for PDAC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,415
Score d'incertitude au seuil0,338

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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