Artificial network inference analysis reveals the impact of biostimulant on bacterial communities in fumigated soil for potato production against common scab
Notice bibliographique
Résumé
Introduction and methods As part of a study on control methods of common scab disease impact on potato yield and quality, high-throughput sequencing was used to measure the effects of soil fumigant chloropicrin alone or in combination with a Bacillus species-based biostimulant on soil bacterial diversity in terms of richness and composition, as well as on soil bacterial network interactions. Results and discussion The results showed that common scab caused significant net yield losses of more than 46.25% in potatoes of control plots (T1), while the use of the fumigant alone (T3) and the use of the fumigant with the biostimulant (T4) reduced net yield losses to less than 2.5%. These treatments also promoted gross yield increases of 23.5 cwt. acre -1 (7.06%) and 28 cwt. acre -1 (8.41%) respectively. The study found that using the soil fumigant chloropicrin significantly and persistently altered the composition of the soil bacterial community over the growing season. The modifications of the soil bacterial community induced by the inoculation of the Bacillus species-based biostimulant are distinct by the end of the growing season depending on whether the soil has been fumigated (T4) or not (T2). Interestingly, artificial network inference analysis showed that the T2 treatment had the highest number of edges and linkages, contrary to the T3 treatment that had the lowest number of edges and linkages. The fumigation alone treatment leads to a reduction in interactions, while the application of the biostimulant, in both non-fumigated and fumigated soil, results in increased interactions and a higher number of connections within a phylum or between different taxa. Furthermore, the treatment combining the fumigant and the biostimulant exhibits a moderate increase in various network properties, providing evidence for the positive effect of biostimulant inoculation on bacterial communities in fumigated soils. Our results provide a more detailed understanding of the bacterial community structure and diversity in the soil of the different treatments. Moreover, deciphering network interactions in soil bacterial communities is fundamentally important for research in soil microbial ecology of potato cropping systems.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».