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Enregistrement W4386695913 · doi:10.1098/rspb.2023.0841

Freshwater connectivity transforms spatially integrated signals of biodiversity

2023· article· en· W4386695913 sur OpenAlexafffund
Joanne E. Littlefair, José Sergio Hleap, Vince Palace, Michael D. Rennie, Michael J. Paterson, Melania E. Cristescu

Notice bibliographique

RevueProceedings of the Royal Society B Biological Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensLakehead UniversityInternational Institute for Sustainable DevelopmentUniversity of GuelphMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsCanada Research ChairsMinistère des Forêts, de la Faune et des Parcs
Mots-clésEnvironmental DNABiodiversityThreatened speciesHabitatEnvironmental scienceAquatic ecosystemEcosystemEcologyZooplanktonSpatial ecologyGeographyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aquatic ecosystems offer a continuum of water flow from headwater streams to inland lakes and coastal marine systems. This spatial connectivity influences the structure, function and dynamics of aquatic communities, which are among the most threatened and degraded on the Earth. Here, we determine the spatial resolution of environmental DNA (eDNA) in dendritic freshwater networks, which we use as a model for connected metacommunities. Our intensive sampling campaign comprised over 420 eDNA samples across 21 connected lakes, allowing us to analyse detections at a variety of scales, from different habitats within a lake to entire lake networks. We found strong signals of within-lake variation in eDNA distribution reflective of typical habitat use by both fish and zooplankton. Most importantly, we also found that connecting channels between lakes resulted in an accumulation of downstream eDNA detections in lakes with a higher number of inflows, and as networks increased in length. Environmental DNA achieves biodiversity surveys in these habitats in a high-throughput, spatially integrated way. These findings have profound implications for the interpretation of eDNA detections in aquatic ecosystems in global-scale biodiversity monitoring observations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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