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Enregistrement W4386761955 · doi:10.1101/2023.09.15.553706

Synergistic action of actin binding proteins regulate actin network organization and cell shape

2023· preprint· en· W4386761955 sur OpenAlexafffund
Murielle P. Serres, Matthew B. Smith, Geneviève Lavoie, Philippe P. Roux, Ewa K. Paluch

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCancer Research Society
Mots-clésCell biologyActinActin remodelingActin-binding proteinCell cortexActin remodeling of neuronsMDia1Actin cytoskeletonCytoskeletonForminsRegulatorMyosinStress fiberBiologyInterphaseMicrofilamentCellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Animal cell shape is largely determined by the organization of the actin cytoskeleton. Spread shapes result from a balance between protrusive actin networks and contractile stress fibers, while rounded shapes are supported by a contractile actomyosin cortex. The assembly and regulation of distinct types of actin networks have been extensively studied, yet, what determines which networks dominate in a given cell remains unclear. In this Brief Report, we explore the molecular regulation of overall actin organization and resulting cell shape. We use our recently published comparison of the F-actin interactome in spread interphase and rounded mitotic cells to establish a list of candidate regulators of actin networks in spread cells. Utilizing micropatterning and automated image analysis we quantitatively analyze how these candidates affect actin organization. Out of our initial 16 candidates, we identify subsets of proteins promoting stress fibers or regulating their arrangement. Interestingly, no single regulator depletion caused significant cell shape change. However, perturbing two hits simultaneously, supervillin and myosin II, led to stress fiber disassembly and cell rounding. Overall, our systematic investigation shows that actin networks are robust to perturbations, and identifies regulatory modules controlling overall actin organization and resulting cell shape.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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