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Enregistrement W4386768549 · doi:10.1101/2023.09.11.557079

The extrafollicular B cell response is a hallmark of childhood idiopathic nephrotic syndrome

2023· preprint· en· W4386768549 sur OpenAlexafffund
Tho-Alfakar Al-Aubodah, Lamine Aoudjit, Giuseppe Pascale, Maneka A. Perinpanayagam, David Langlais, Martin Bitzan, Susan Samuel, Ciriaco A. Piccirillo, Tomoko Takano

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMcGill UniversityUniversity of CalgaryMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFonds de Recherche du Québec - SantéKidney Foundation of CanadaMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésMarginal zoneCD11cImmunologyB cellBiologyRituximabImmune systemHumoral immunityAntibodyGeneticsPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract An autoimmune B cell origin for childhood idiopathic nephrotic syndrome (INS) is predicted based on the efficacy of rituximab (RTX) at maintaining long-term remission from proteinuria. Knowledge regarding the nature of the culprit B cell response is very limited. Using single-cell RNA-sequencing, we demonstrate that a B cell transcriptional program poised for effector functions represents the major immune perturbation in the blood of children with active INS. This was conferred by the engagement of an extrafollicular B cell response marked by the expansion of atypical B cells (atBCs), marginal zone-like B cells, and antibody-secreting cells (ASCs). In flow-based analyses of blood from 13 children with active INS and 24 healthy donors, this was reflected by the proliferation of RTX-sensitive extrafollicular (CXCR5 − ) CD21 low T-bet + CD11c + atBCs, and short-lived T-bet + ASCs. Together, our study provides evidence for an extrafollicular origin for humoral immunity in active INS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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