Abstract PO-037: Biomarkers for early diagnosis of human papillomavirus-related oropharyngeal cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: To counteract the rapidly increasing incidence of human papillomavirus (HPV)-related oropharyngeal cancer (OPC), development of effective biomarkers and other novel screening strategies are necessary to effectively detect early disease in well-defined high-risk populations. The most promising biomarkers are circulating tumor HPV DNA (ctHPV), antibodies (Abs) to HPV16 early (E) antigens, and persistent infection with oral oncogenic HPV. Here, we report the prevalence of ctHPV in a population of middle-aged men, a group with high OPC incidence, and evaluate concordance between the three HPV biomarkers. Materials and Methods: We included participants enrolled in the HPV-related Oropharyngeal and Uncommon Cancers Screening Trial of Men (HOUSTON) study between April 2017 and December 2019. The HOUSTON study was designed to evaluate biomarkers and novel screening strategies for HPV-related cancers among middle-aged men (50-64 years), the group with the highest incidence of HPV-related OPC. We tested plasma for ctHPV using a digital droplet polymerase chain reaction (ddPCR) assay (NavDx, Naveris, Waltham, MA). We previously tested the plasma from these participants for HPV16 E Abs using a novel RAPID ELISA and for prevalent oral HPV16 (oHPV16) infection in oral rinse using the cobas HPV Test (Roche Diagnostics, Indianapolis, IN). We used Fisher’s exact test to determine statistical significance for the association between biomarkers (alpha < 0.05). Results: Of 345 samples tested, 343 were adequate for ctHPV analysis. Of these, 314 were negative (92.4%) and two were positive (0.6%; both for HPV16). Twenty-four had an indeterminate (Ind) result (7.0%), meaning ctHPV levels fell outside the established parameters for a negative or positive results. All three markers were available for 340 samples with the following results: ctHPV+/Ab+/oHPV16+: 1 (0.3%); ctHPV+/Ab-/oHPV16-: 1 (0.3%); ctHPV Ind/Ab-/oHPV16+: 3 (0.9%); ctHPV Ind/Ab-/oHPV16-: 21 (6.2%); ctHPV-/Ab+/oHPV16+: 1 (0.3%); ctHPV-/Ab+/oHPV16-: 3 (0.9%); ctHPV-/Ab-/oHPV16+: 16 (4.7%); ctHPV-/Ab-/oHPV16-: 294 (86.5%); all other combinations had no observations. ctHPV was associated with HPV16 E Abs and oHPV16 status individually and combined (individually, p = 0.032 for both and combined, p = 0.025). A ctHPV-/Ab+/oHPV16-man was diagnosed with an anal low-grade squamous intraepithelial lesion and was persistently high-risk HPV-positive at the right tonsil/base of tongue. One man was positive for all three markers and was subsequently diagnosed with stage II (T1N1) HPV16-positive/Epstein-Barr-negative nasopharyngeal cancer four months following study enrollment. Conclusions: ctHPV was rare in a general population of middle-aged men. Our results suggest that these markers in combination may be able to correctly identify early HPV-related cancers. Larger studies are needed to confirm this finding. The authors accept sole responsibility for the statements in this abstract. Citation Format: Kristina R. Dahlstrom, Karen S. Anderson, Erich M. Sturgis. Biomarkers for early diagnosis of human papillomavirus-related oropharyngeal cancer [abstract]. In: Proceedings of the AACR-AHNS Head and Neck Cancer Conference: Innovating through Basic, Clinical, and Translational Research; 2023 Jul 7-8; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2023;29(18_Suppl):Abstract nr PO-037.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».