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Enregistrement W4386790642 · doi:10.1101/2023.09.14.557733

<i>Fusarium graminearum</i> Ste2 and Ste3 Receptors Undergo Peroxidase Induced Heterodimerization

2023· preprint· en· W4386790642 sur OpenAlexafffund
Tanya Sharma, Robert Y. Jomphe, Dongling Zhang, Ana C. Magalhães, Michèle C. Loewen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Biology and Applications
Établissements canadiensNational Research Council CanadaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaQueen's University
Mots-clésChemistryReceptorPeroxidaseLigand (biochemistry)G protein-coupled receptorContext (archaeology)BiochemistryEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract F. graminearum Fg Ste2 and Fg Ste3 are G-protein coupled receptors (GPCRs) recently shown to play roles in mediating fungal hyphal chemotropism and plant pathogenesis in response to activity arising from host-released peroxidases. Here, we follow up on the previous observation that chemotropism is dependent on both Fg Ste2 and Fg Ste3 being present at the same time; testing the possibility that this effect might be due to formation of an Fg Ste2- Fg Ste3 heterodimer. Initially the recombinant cell-surface expression of the F. graminearum GPCRs was validated in S. cerevisiae by confocal immunofluorescence microscopy. Bioluminescence resonance energy transfer analyses were subsequently conducted, where the addition of horse radish peroxidase (HRP) was found to increase the transfer of energy from the inducibly-expressed Fg Ste3-Nano luciferase ( Fg Ste3-NLuc) donor, to the constitutively-expressed Fg Ste2-yellow fluorescent protein ( Fg Ste2-YFP) acceptor, compared to controls. A partial response was also detected when an HRP-derived ligand-containing extract was enriched from F. graminearum spores and applied to the S. cerevisiae BRET system directly. The selectivity of the interaction was demonstrated by comparison to treatment with pheromones as well as an unrelated bovine GPCR, rhodopsin, fused to YFP as acceptor, that yielded no response when co-expressed with Fg Ste3-NLuc. Finally, the peroxidase-stimulated heterodimerization was validated by affinity pulldown. Taken together these findings demonstrate the formation of HRP and HRP-derived ligand stimulated heterodimers between Fg Ste2 and Fg Ste3. Outcomes are discussed from the context of the roles of ligands and reactive oxygen species in GPCR dimerization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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