Dose effects of restorer gene modulate pollen fertility in cotton CMS-D2 restorer lines via auxin signaling and flavonoid biosynthesis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract CMS-D2 is an economical and effective system for producing hybrid cotton seeds than artificial and chemical emasculation methods. However, the unstable restoring ability of restorer lines is a main barrier in the large-scale application of "three-line" hybrid cotton. Our phenotypic investigation determined that the homozygous Rf1Rf1 allelic genotype had a stronger ability to generate fertile pollen than the heterozygous Rf1rf1 allelic genotype. To decipher the genetic mechanisms that control the differential levels of pollen fertility, an integrated metabolomic and transcriptomic analysis was performed on pollen grains at two environments using four cotton genotypes differing in Rf1 alleles or cytoplasm. Totally 5,391 differential metabolite features were detected, and 369 specific differential metabolites (DMs) were identified between homozygous and heterozygous Rf1 allelic genotypes with CMS-D2 cytoplasm. Additionally, transcriptome analysis identified 2,490 differentially expressed genes (DEGs) and 96 unique hub DEGs with dynamic regulation in this comparative combination. Further integrated analyses revealed that several key DEGs and DMs involved in indole biosynthesis, flavonoid biosynthesis, and sugar metabolism had strong network linkage with fertility restoration. In vitro application of auxin analogue NAA and inhibitor Auxinole confirmed that over-activated auxin signaling might inhibit pollen development whereas suppressing auxin signaling partially promoted pollen development in CMS-D2 cotton. Our results provide new insight into how the dosage effects of the Rf1 gene regulate pollen fertility of CMS-D2 cotton.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».