MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4386800630 · doi:10.1093/neuonc/noad147.087

THE ROLE OF A GENOMICS CLINICAL NURSE SPECIALIST IN HELPING TO BUILD A PATHWAY FOR WHOLE GENOME SEQUENCING TO BE OFFERED TO NEURO-ONCOLOGY PATIENTS

2023· article· en· W4386800630 sur OpenAlexaff
Aeron Suarez, Victoria Hurwitz, Jessica La, Charlotte Robinson, Ellie Kostick, Sarah Hedges, Nicola Harding, Renata Fukuthi, Ana Flávia Nepomuceno Dias, Anwar Alhaq, Barnaby Clark, Safa Al‐Sarraj, Ross C. Laxton, Kelly Eggleton, Ranjeev Bhangoo, Keyoumars Ashkan, Richard Gullan, Francesco Vergani, José Pedro Lavrador, Cristina Bleil, Bassel Zebian, Lucy Brazil, Omar Al-Salihi, Angela Swampillai, Kazumi Chia, Vishal Manik

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClinical nurse specialistMedicineTest (biology)Oncology nursingInformed consentNursingWhole genome sequencingGenomeNurse educationPathologyGeneticsGeneAlternative medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract AIMS Whole genome sequencing is currently being offered to paediatric, teenage and young adult neuro-oncology patients and this was being managed by a genomics practitioner who works cross-site. We found that some patients are being discharged from the hospital without 1 component of the test or the consent. Our aim is to create a solid pathway in which fresh tissue, blood sample and record of discussion are taken at a certain stage in their hospital admission. METHOD A poster was created to remind the theatre team that a fresh tumour tissue and EDTA blood sample are the required samples to proceed with whole genome sequencing. Consent training is being provided to all clinical nurse specialists who look after CNS tumours in order to secure the record of discussion at any point in their hospital appointment. After several shadowing and doing the consenting process with supervision, they are expected to be able to be independent in doing this. RESULTS The clinical nurse specialist team have consented 24 out of 37 paediatric, teenage and young adult neuro- oncology patients that were operated since July 2022. Almost all of them have had their bloods taken intra- operatively with some taken whilst still an in-patient. CONCLUSIONS Whole genome sequencing will soon be offered to all neuro-oncology patients and the entire team will need to be equipped in securing the record of discussion in order for this test to proceed and this will be led by the clinical nurse specialist team.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,152

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0050,002
Communication savante0,0040,005
Science ouverte0,0020,008
Intégrité de la recherche0,0040,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0450,017

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuro-OncologyMême sujetCancer Genomics and DiagnosticsTravaux en français237 207