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Enregistrement W4386807196 · doi:10.1016/j.vaccine.2023.09.012

Protocol for a living evidence synthesis on variants of concern and COVID-19 vaccine effectiveness

2023· article· en· W4386807196 sur OpenAlexafffund
Nicole Shaver, Melanie Katz, Gideon Darko Asamoah, Lori‐Ann Linkins, Wael Abdelkader, Andrew Beck, Alexandria Bennett, Sarah Hughes, Maureen Smith, Mpho Begin, Doug Coyle, Thomas Piggott, Benjamin M. Kagina, Vivian Welch, Caroline Colijn, David J. D. Earn, Khaled El Emam, Jane M. Heffernan, Sheila F. O’Brien, Kumanan Wilson, Erin Collins, Tamara Navarro, Joseph Beyene, Isabelle Boutron, Dawn M. E. Bowdish, Curtis Cooper, Andrew P. Costa, Janet Curran, Lauren E. Griffith, Amy T. Hsu, Jeremy Grimshaw, Marc‐André Langlois, Xiaoguang Li, Anne Pham‐Huy, Parminder Raina, Michele Rubini, Lehana Thabane, Hui Wang, Xu Lan, Melissa Brouwers, Tanya Horsley, John N. Lavis, Alfonso Iorio, Julian Little

Notice bibliographique

RevueVaccine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonDalhousie UniversityUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenRoyal College of Physicians and Surgeons of CanadaUniversity of TorontoMcMaster University Medical CentreOttawa HospitalCanadian Blood ServicesOkanagan University CollegeUniversity of British Columbia, Okanagan CampusSickKids FoundationYork UniversityUniversity of OttawaPublic Health Agency of CanadaSimon Fraser UniversityImpactBruyèreOttawa Public HealthCochraneCARE CanadaQueen's UniversityMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchModernaUK Research and Innovation
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakVirologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)PandemicMedicineBetacoronavirusProtocol (science)BiologyInfectious disease (medical specialty)Outbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: It is evident that COVID-19 will remain a public health concern in the coming years, largely driven by variants of concern (VOC). It is critical to continuously monitor vaccine effectiveness as new variants emerge and new vaccines and/or boosters are developed. Systematic surveillance of the scientific evidence base is necessary to inform public health action and identify key uncertainties. Evidence syntheses may also be used to populate models to fill in research gaps and help to prepare for future public health crises. This protocol outlines the rationale and methods for a living evidence synthesis of the effectiveness of COVID-19 vaccines in reducing the morbidity and mortality associated with, and transmission of, VOC of SARS-CoV-2. METHODS: Living evidence syntheses of vaccine effectiveness will be carried out over one year for (1) a range of potential outcomes in the index individual associated with VOC (pathogenesis); and (2) transmission of VOC. The literature search will be conducted up to May 2023. Observational and database-linkage primary studies will be included, as well as RCTs. Information sources include electronic databases (MEDLINE; Embase; Cochrane, L*OVE; the CNKI and Wangfang platforms), pre-print servers (medRxiv, BiorXiv), and online repositories of grey literature. Title and abstract and full-text screening will be performed by two reviewers using a liberal accelerated method. Data extraction and risk of bias assessment will be completed by one reviewer with verification of the assessment by a second reviewer. Results from included studies will be pooled via random effects meta-analysis when appropriate, or otherwise summarized narratively. DISCUSSION: Evidence generated from our living evidence synthesis will be used to inform policy making, modelling, and prioritization of future research on the effectiveness of COVID-19 vaccines against VOC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,200
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,350
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,200
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2000,350
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0070,007
Méta-épidémiologie (sens large)0,0160,021
Bibliométrie0,0130,011
Études des sciences et des technologies0,0060,007
Communication savante0,0110,008
Science ouverte0,0070,007
Intégrité de la recherche0,0200,015
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1550,031

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,125
Tête enseignante GPT0,446
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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