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Enregistrement W4386810208 · doi:10.1007/s13199-023-00934-8

Algal symbionts of the freshwater sponge Ephydatia muelleri

2023· article· en· W4386810208 sur OpenAlexaffabout
Katelyn Hustus, Cristina Díez‐Vives, Konstantina Mitsi, Jasmine Nutakki, Victor Kering, Ivy T. Nguyen, M. Spencer, Sally P. Leys, Malcolm Hill, Ana Riesgo, April Hill

Notice bibliographique

RevueSymbiosis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthFundación Bancaria Caixa d'Estalvis i Pensions de Barcelona“la Caixa” FoundationGordon and Betty Moore Foundation
Mots-clésBiologySpongeSymbiosisAlgaeMicrobiomeCladeMutualism (biology)BotanyEcologyZoologyBacteriaPhylogeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The freshwater sponge, Ephydatia muelleri, is an emerging model system for studying animal:microbe symbioses. Intracellular green microalgae are one of the more common symbionts that live in a facultative mutualism with E. muelleri. While these symbioses have long been known, the identity of the algal symbionts in E. muelleri cells has not been studied in detail. Here, we isolate and characterize endosymbiotic algae from E. muelleri collected from different geographic locations. We find that the algae can be transmitted through asexually produced gemmules and importantly that they can form symbioses with different, differentiated sponge cell types in the adult sponge. Our findings indicate that at least two algal lineages form endosymbioses with E. muelleri. One of the lineages includes species commonly found in samples from two locations in Canada and one in the United States (clade 1: closely related to Auxenochlorella pyrenoidosa). The other clade includes algae found in sponges from one site in Maine, USA, and Lewiniosphaera symbiontica, which is a strain isolated in 1956 from the freshwater sponge Spongilla. We compared microbiomes found in cultures of microalgae as well as the original sponge hosts, and found that very similar bacterial microbiomes associate with both clades (91 orders of Bacteria are shared among the samples we compared). The microbiomes found in the cultures resemble, with a high degree of overlap, the microbiome associated with the sponge host.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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