Circular RNA profiling identifies <i>circ5078</i> as a <i>BMPR2</i> -derived regulator of endothelial proliferation and stress responses
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Germline loss-of-function BMPR2 mutations are the leading genetic cause of pulmonary arterial hypertension (PAH) and are strongly linked to aberrant endothelial proliferation and impaired translational stress responses. While these effects are generally attributed to a loss of the type-II bone morphogenetic protein receptor (BMPR-II), we used circular RNA profiling to identify circ5078 as a new functional RNA derived from exon 12 of the BMPR2 gene. circ5078 and linear BMPR2 mRNA exert opposing effects on endothelial proliferation and stress granule formation, driving impaired stress responses in PAH patient-derived endothelial cells that are deficient in linear BMPR2 transcripts, but not circ5078 . Rebalancing circular to linear transcript abundance by circ5078 depletion rescued stress granule formation in patient-derived endothelial cells, independent of BMPR-II protein levels. Polysome analysis demonstrated a reduction in free ribosomal subunits with the depletion of either linear or circular BMPR2 transcripts, and an accumulation of 80S monosomes exclusively with linear BMPR2 mRNA loss. These effects did not impact global protein synthesis or stress-induced eIF2α phosphorylation, but did alter the translational efficiency of multiple genes, including a group of nuclear encoded, mitochondrial ribosome proteins that were translationally enhanced with circ5078 silencing. Endothelial circ5078 depletion increased the efficiency of oxidative metabolism while reducing mitochondrial spare capacity, providing a potential link between mitochondrial function, proliferation and translational stress responses. Together, these findings reveal interdependent roles for linear and circular BMPR2 transcripts as functional contributors to the endothelial phenotype of PAH.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».