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Enregistrement W4386824625 · doi:10.1101/2023.09.17.23295670

A systematic review of genome-wide association studies on bladder cancer

2023· review· en· W4386824625 sur OpenAlexaboutno aff
Aliyu Adamu Ahmad, Umar Muhammad, Buhari Ibrahim, Suleiman Hamidu Kwairanga, ⁠Usman Adamu Garkuwa, Murtala Muhammad Jibril, Umar Ahmad

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBladder cancerGenome-wide association studyMedicineGenetic associationGenetic predispositionOncologyCancerBiologyGeneticsInternal medicineDiseaseSingle-nucleotide polymorphismGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Bladder cancer (BC) is the most common cancer of the urinary tract worldwide with over 550,000 new cases each year, bladder cancer has drawn relatively limited research attention and healthcare interventions despite the escalating incidence and mortality rates, particularly in Africa. Historically, the clinical handling of bladder cancer remained largely unchanged for many years. However, novel research initiatives have heralded a fresh epoch in its diagnosis and treatment, fueled by detailed probing of molecular changes. Aim This study aimed to identify genetic susceptibility loci associated with bladder cancer by systematically reviewing previous Genome-Wide Association Studies (GWAS). Methods In line with this objective, comprehensive literature searches were conducted across PubMed, Google Scholar, and relevant genetic databases, focusing on bladder cancer GWAS studies from 2000 through to November 2022. This systematic review adhered to the robust PRISMA standards. To evaluate the credibility of the studies under scrutiny, the Newcastle-Ottawa Scale was employed, further assessing any potential bias risk. Results The investigation identified chromosome 18q12.3 as the most vulnerable to bladder cancer, revealing four polymorphisms at this locus: rs7238033, rs10775480, rs11082469, and rs17674580. Furthermore, chromosome 5p15.3 emerged as the second most susceptible, with three noted polymorphisms: rs2736098 and two instances of rs401681. Conclusion Despite these findings, our understanding of genetic predisposition to bladder cancer remains rudimentary, with the majority of substantial data deriving from GWAS. No additional genetic association evidence emerged from this systematic review. Given the relatively minor influence of our current knowledge of genetic susceptibility to bladder cancer on public health, a call for larger cohort studies is necessary. These expanded studies can potentially unveil a broader range of significant polymorphisms across the genome, thereby enhancing our understanding and approach to bladder cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,046
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,052

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,046
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,008
Bibliométrie0,0160,019
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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