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Enregistrement W4386850841 · doi:10.1111/bjh.19107

Ratio of stemness to interferon signalling as a biomarker and therapeutic target of myeloproliferative neoplasm progression to acute myeloid leukaemia

2023· article· en· W4386850841 sur OpenAlexafffund
Fabíola Attié de Castro, Parinaz Mehdipour, Ankur Chakravarthy, Ilias Ettayebi, Helen Loo Yau, Tiago da Silva Medina, Sajid A. Marhon, Felipe Campos de Almeida, Thiago Mantello Bianco, Andrea Arruda, Rebecca Devlin, Lorena Lobo de Figueiredo‐Pontes, Fernando Chahud, Maira da Costa Cacemiro, Mark D. Minden, Vikas Gupta, Daniel D. De Carvalho

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Haematology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMyeloproliferative Neoplasms: Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesInstituto Nacional de Ciência e Tecnologia da CriosferaConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloInstitute of Cancer ResearchOntario Institute for Cancer ResearchWorld Health Organization
Mots-clésMyeloproliferative neoplasmInterferonCancer researchBiologyMyeloidBiomarkerImmunologyStem cellMyelofibrosisBone marrowCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Progression to aggressive secondary acute myeloid leukaemia (sAML) poses a significant challenge in the management of myeloproliferative neoplasms (MPNs). Since the physiopathology of MPN is closely linked to the activation of interferon (IFN) signalling and that AML initiation and aggressiveness is driven by leukaemia stem cells (LSCs), we investigated these pathways in MPN to sAML progression. We found that high IFN signalling correlated with low LSC signalling in MPN and AML samples, while MPN progression and AML transformation were characterized by decreased IFN signalling and increased LSC signature. A high LSC to IFN expression ratio in MPN patients was associated with adverse clinical prognosis and higher colony forming potential. Moreover, treatment with hypomethylating agents (HMAs) activates the IFN signalling pathway in MPN cells by inducing a viral mimicry response. This response is characterized by double-stranded RNA (dsRNA) formation and MDA5/RIG-I activation. The HMA-induced IFN response leads to a reduction in LSC signature, resulting in decreased stemness. These findings reveal the frequent evasion of viral mimicry during MPN-to-sAML progression, establish the LSC-to-IFN expression ratio as a progression biomarker, and suggests that HMAs treatment can lead to haematological response in murine models by re-activating dsRNA-associated IFN signalling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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