MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4386864840 · doi:10.7554/elife.89100.1.sa1

Reviewer #1 (Public Review): Loss of Tumour Suppressor TMEM127 Drives RET-mediated Transformation Through Disrupted Membrane Dynamics

2023· peer-review· en· W4386864840 sur OpenAlexfundno aff
Walker Timothy J., Reyes-Alvarez Eduardo, Brandy D. Hyndman, Michael G. Sugiyama, Oliveira Larissa, Rekab Aisha N., Crupi Mathieu J.F., Cabral-Dias Rebecca, Guo Qianjin, Dahia Patricia, Douglas S. Richardson, Antonescu Costin N., Lois M. Mulligan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNeuroendocrine Tumor Research FoundationCancer Research SocietyUniversity of Texas System
Mots-clésCell biologyInternalizationEndosomeReceptor tyrosine kinaseTransmembrane proteinCell surface receptorEndocytosisBiologySignal transductionCell membraneReceptorCellCarcinogenesisChemistryBiochemistryIntracellularCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Internalization from the cell membrane and endosomal trafficking of receptor tyrosine kinases (RTK) are important regulators of signaling in normal cells that can frequently be disrupted in cancer. The adrenal tumour pheochromocytoma (PCC) can be caused by activating mutations of the RET receptor tyrosine kinase, or inactivation of TMEM127, a transmembrane tumour suppressor implicated in trafficking of endosomal cargos. However, the role of aberrant receptor trafficking in PCC is not well understood. Here, we show that loss of TMEM127 causes wildtype RET protein accumulation on the cell surface, where increased receptor density facilitates constitutive ligand-independent activity and downstream signaling, driving cell proliferation. Loss of TMEM127 altered normal cell membrane organization and recruitment and stabilization of membrane protein complexes, impaired assembly, and maturation of clathrin coated pits, and reduced internalization and degradation of cell surface RET. In addition to RTKs, TMEM127 depletion also promoted surface accumulation of several other transmembrane proteins, suggesting it may cause global defects in surface protein activity and function. Together, our data identify TMEM127 as an important determinant of membrane organization, including membrane protein diffusability and protein complex assembly, and provide a novel paradigm for oncogenesis in PCC where altered membrane dynamics promotes cell surface accumulation and constitutive activity of growth factor receptors to drive aberrant signaling and promote transformation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,027
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,164
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,973
Score d'incertitude au seuil0,279

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0270,164
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0080,004
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0140,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0830,053

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineÉvaluation
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetCellular transport and secretion→Travaux en français237 207→