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Enregistrement W4386874410 · doi:10.7554/elife.89368.1.sa1

Reviewer #2 (Public Review): Distinctive Whole-brain Cell-Types Strongly Predict Tissue Damage Patterns in Eleven Neurodegenerative Disorders

2023· peer-review· en· W4386874410 sur OpenAlexafffund
Veronika Pak, Quadri Adewale, Danilo Bzdok, Mahsa Dadar, Yashar Zeighami, Yasser Iturria‐Medina

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMila - Quebec Artificial Intelligence InstituteMcGill UniversityDouglas College
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaFondation Brain CanadaMcGill University
Mots-clésNeurodegenerationNeuroscienceFrontotemporal dementiaAmyotrophic lateral sclerosisBiologyCell typeMicrogliaDementiaDiseasePathologyCellMedicineInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For over a century, brain research narrative has mainly centered on neuron cells. Accordingly, most whole-brain neurodegenerative studies focus on neuronal dysfunction and their selective vulnerability, while we lack comprehensive analyses of other major cell-types’ contribution. By unifying spatial gene expression, structural MRI, and cell deconvolution, here we describe how the human brain distribution of canonical cell-types extensively predicts tissue damage in eleven neurodegenerative disorders, including early- and late-onset Alzheimer’s disease, Parkinson’s disease, dementia with Lewy bodies, amyotrophic lateral sclerosis, frontotemporal dementia, and tauopathies. We reconstructed comprehensive whole-brain reference maps of cellular abundance for six major cell-types and identified characteristic axes of spatial overlapping with atrophy. Our results support the strong mediating role of non-neuronal cells, primarily microglia and astrocytes, on spatial vulnerability to tissue loss in neurodegeneration, with distinct and shared across-disorders pathomechanisms. These observations provide critical insights into the multicellular pathophysiology underlying spatiotemporal advance in neurodegeneration. Notably, they also emphasize the need to exceed the current neuro-centric view of brain diseases, supporting the imperative for cell-specific therapeutic targets in neurodegeneration.Major cell-types distinctively associate with spatial vulnerability to tissue loss in eleven neurodegenerative disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,049
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,331
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,262

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0490,331
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0040,003
Communication savante0,0080,005
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0140,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0780,039

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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