Influence of central metabolism disruption on <i>Escherichia coli</i> biofilm formation
Notice bibliographique
Résumé
Biofilms are widely recognized as a prominent mode of microbial growth and strategy of antimicrobial tolerance in many environments. Characteristics that are often overlooked in biofilm investigations include the examination of metabolic pathways as the assumption might be that interference with central pathways such as glycolysis would only reduce growth and thus not be meaningful. Using the Keio collection of Escherichia coli mutants, we investigated the influence of biofilm formation and planktonic growth in full-strength and diluted Luria–Bertani (LB) broths using strains with a disruption of glycolysis (Δ pgi), the Entner–Doudoroff pathway (Δ edd), or the pentose phosphate pathway (Δ gnd). Unexpectedly, in contrast to the E. coli Keio parent strain (BW25113), planktonic growth was enhanced in full strength and diluted LB broths in the metabolic mutants. Using a microtiter biofilm assay, the E. coli parent strain showed the highest crystal violet staining. However, when analyzed by culture assays, there was an increase in biofilm populations in the mutants in comparison to the parent strain. Fluorescence microscopy showed differences in colonization patterns in the strains. Given the availability of mutant collections in many model organisms, similar metabolic studies are warranted for biofilms, given their importance in nature.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».