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Enregistrement W4386887825 · doi:10.1038/s41467-023-39824-4

Evidence of a causal and modifiable relationship between kidney function and circulating trimethylamine N-oxide

2023· article· en· W4386887825 sur OpenAlexaff
Petros Andrikopoulos, Judith Aron‐Wisnewsky, Rima Chakaroun, Antonis Myridakis, Sofia K. Forslund, Trine Nielsen, Solia Adriouch, Bridget Holmes, Julien Chilloux, Sara Vieira‐Silva, Gwen Falony, Joe‐Elie Salem, Fabrizio Andreelli, Eugeni Belda, Julius Kieswich, Kanta Chechi, Francesc Puig‐Castellví, Mickaël Chevalier, Emmanuelle Le Chatelier, Michael Olanipekun, Lesley Hoyles, Renato Alves, Gérard Helft, Richard Isnard, Lars Køber, Luís Pedro Coelho, Christine Rouault, Dominique Gauguier, Jens Peter Gøtze, Edi Prifti, Philippe Froguel, Rohia Alili, Ehm Astrid Andersson Galijatovic, Olivier Barthélemy, Jean‐Philippe Bastard, Jean-Paul Batisse, Pierre Bel-Lassen, Magali Berland, Randa Bittar, Hervé M. Blottière, F Bosquet, Rachid Boubrit, Olivier Bourron, Mickaël Camus, Cécile Ciangura, Jean‐Philippe Collet, Arne Dietrich, Morad Djebbar, Angélique Doré, Line Engelbrechtsen, Léopold Fezeu, Sébastien Fromentin, Nicolas Pons, Marianne Graine, Caroline Grünemann, Agnès Hartemann, Bolette Hartmann, Malene Hornbak, Sophie Jaqueminet, Niklas Rye Jørgensen, Hanna Julienne, Johanne Marie Justesen, Judith Kammer, Nikolaj Karup, Ruby Kozlowski, Michael Kuhn, Véronique Lejard, Ivica Letunić, Florence Levenez, Lajos Markó, Laura Martínez-Gili, Robin Massey, Nicolas Maziers, Lucas Moitinho‐Silva, Gilles Montalescot, Ana Luísa Neves, Laetitia Pasero Le Pavin, Françoise Pousset, Andrea Rodriguez‐Martinez, Sebastien Schmidt, Tatjana Schütz, Lucas F. M. da Silva, Johanne Silvain, Mathilde Svendstrup, T.D. Swartz, Thierry Vanduyvenboden, Eric O. Verger, Stefanie Walther, Jean‐Daniel Zucker, Fredrik Bäckhed, Henrik Vestergaard, Torben Hansen, Jean‐Michel Oppert, Matthias Blüher, Jens Nielsen, Jeroen Raes, Peer Bork, Muhammad M. Yaqoob, Michael Stümvoll, Oluf Pedersen, S. Dusko Ehrlich, Karine Clément, Marc‐Emmanuel Dumas

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet and metabolism studies
Établissements canadiensMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesInstitut de Cardiométabolisme et NutritionNIHR Imperial Biomedical Research CentreSeventh Framework ProgrammeAssistance publique-Hôpitaux de ParisInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleFondation LeducqEuropean CommissionNovo Nordisk FondenSociété Française de NutritionDiabetes UKNovo Nordisk Foundation Center for Basic Metabolic ResearchNovo NordiskNational Institute for Health and Care ResearchCHIST-ERAAgence Nationale de la RechercheMedical Research CouncilInternational Seafood Sustainability FoundationCentre National de la Recherche ScientifiqueConseil Régional Hauts-de-FranceBarts Charity
Mots-clésTrimethylamine N-oxideFunction (biology)TrimethylamineRenal functionChemistryComputational biologyMedicineBiologyBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The host-microbiota co-metabolite trimethylamine N-oxide (TMAO) is linked to increased cardiovascular risk but how its circulating levels are regulated remains unclear. We applied "explainable" machine learning, univariate, multivariate and mediation analyses of fasting plasma TMAO concentration and a multitude of phenotypes in 1,741 adult Europeans of the MetaCardis study. Here we show that next to age, kidney function is the primary variable predicting circulating TMAO, with microbiota composition and diet playing minor, albeit significant, roles. Mediation analysis suggests a causal relationship between TMAO and kidney function that we corroborate in preclinical models where TMAO exposure increases kidney scarring. Consistent with our findings, patients receiving glucose-lowering drugs with reno-protective properties have significantly lower circulating TMAO when compared to propensity-score matched control individuals. Our analyses uncover a bidirectional relationship between kidney function and TMAO that can potentially be modified by reno-protective anti-diabetic drugs and suggest a clinically actionable intervention for decreasing TMAO-associated excess cardiovascular risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,415

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,133
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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