Loop-mediated isothermal amplification identifies nematode Leidynema in the hindgut of non-pest cockroach
Notice bibliographique
Résumé
Cockroach microbiome studies generally focus on pest cockroach species belonging to the Blattidae and Ectobiidae families. There are no reports characterizing the gut microbiome of non-pest cockroach species Blaberus discoidalis (family Blaberidae), which is commonly used as a food source for insectivorous animals. We discovered the parasitic nematode Leidynema appendiculata in the B. discoidalis hindgut during initial work characterizing the gut microbiome of this organism. To determine the proportion of the B. discoidalis colony that was colonized by L. appendiculata, 28 S rDNA was amplified using two Methods: endpoint polymerase chain reaction (PCR) and loop-mediated isothermal amplification (LAMP). B. discoidalis colonies were raised on three diet types (control, high fibre, and high fat and salt) for 21 days before dissection. Each individual was sexed during dissection to identify potential sex-based effects of colonization. Data collected were analysed to determine if diet and sex impacted parasite colonization patterns. LAMP detected a higher proportion of parasite positive samples when compared to endpoint PCR. No sex- or diet-based differences in L. appendiculata colonization were found. This study adds to the limited existing knowledge of the B. discoidalis gut microbiome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».