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Enregistrement W4386950379 · doi:10.21203/rs.3.rs-3282845/v1

Effects of SP-2509 and OG-L002 on lipophagy using target or off-target molecules in glycolysis-suppressed pancreatic ductal adenocarcinoma cells

2023· preprint· en· W4386950379 sur OpenAlexaff
Shigeki Aoki, Zhiheng Zhang, Haruna Aoki, Keitaro Umezawa, Joshua Kranrod, Natsumi Miyazaki, Taichi Oshima, Takuya Hirao, Yuri Miura, John M. Seubert, Kousei Ito

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceYasuda Memorial Medical FoundationSGH Foundation
Mots-clésPancreatic ductal adenocarcinomaGlycolysisCancer researchChemistryInternal medicineBiologyEndocrinologyMedicinePancreatic cancerCancerMetabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Although increased aerobic glycolysis is common in cancers, pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) cells can survive glycolysis suppression. We aimed to identify potential therapeutic targets in glycolysis-suppressed PDAC cells. By screening anticancer metabolic compounds, we identified SP-2509, a selective lysine-specific demethylase (LSD) 1 inhibitor. SP-2509 lowered the viability of three distinct human PDAC cell lines (PANC-1, PK-1, and KLM-1 cells) under glycolysis suppression. The effects of three other LSD1 inhibitors (OG-L002, iadademstat, and T-3775440) on PDAC cell viability were investigated; OG-L002, but not iadademstat or T-3775440, lowered PDAC cell viability under glycolysis suppression, similar to SP-2509. However, knockdown of LSD1/LSD2 failed to lower the viability of PDAC cells subjected to glycolysis suppression. SP-2509 and OG-L002 lowered PDAC cell viability even when given to cells which already been depleted of LSD-1, subjected to glycolysis suppression. Proteomic analyses implied that glucose-starvation causes PDAC cells to switch to mitochondrial oxidative phosphorylation. We observed that fatty acid metabolism is important for the survival of PDAC cells following the suppression of glycolysis. SP-2509 and OG-L002 promoted lipid droplet accumulation in PDAC cells under glycolysis suppression by inhibiting lipophagy. This indicates the significant potential of SP-2509 and OG-L002 to impair oncogenic cell proliferation through regulation of lipophagic fluxes. SP-2509 showed anti-tumor effects of PDAC in 2-DG-treated mice with lipid droplet accumulation and alteration of the tumor microenvironment. Hence, there is potentially new therapeutic strategies for PDAC in the presence of dual inhibition of glycolysis and fatty acids metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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