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Enregistrement W4386951819 · doi:10.1126/sciadv.adh4978

An antibody-based molecular switch for continuous small-molecule biosensing

2023· article· en· W4386951819 sur OpenAlexfundno aff
Ian A. P. Thompson, Jason Saunders, Liwei Zheng, Amani A. Hariri, Nicolò Maganzini, Alyssa P. Cartwright, Jing Pan, Steven Yee, Constantin Dory, Michael Eisenstein, Jelena Vučković, H. Tom Soh

Notice bibliographique

RevueScience Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Biosensing Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaWellcome TrustLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable TrustNational Science Foundation
Mots-clésBiosensorModular designBuffer (optical fiber)DigoxigeninAntibodyAntibody microarrayNanotechnologySmall moleculeChemistryMaterials scienceBiophysicsComputer scienceBiologyBiochemistryImmunologyTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present a generalizable approach for designing biosensors that can continuously detect small-molecule biomarkers in real time and without sample preparation. This is achieved by converting existing antibodies into target-responsive "antibody-switches" that enable continuous optical biosensing. To engineer these switches, antibodies are linked to a molecular competitor through a DNA scaffold, such that competitive target binding induces scaffold switching and fluorescent signaling of changing target concentrations. As a demonstration, we designed antibody-switches that achieve rapid, sample preparation-free sensing of digoxigenin and cortisol in undiluted plasma. We showed that, by substituting the molecular competitor, we can further modulate the sensitivity of our cortisol switch to achieve detection at concentrations spanning 3.3 nanomolar to 3.3 millimolar. Last, we integrated this switch with a fiber optic sensor to achieve continuous sensing of cortisol in a buffer and blood with <5-min time resolution. We believe that this modular sensor design can enable continuous biosensor development for many biomarkers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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