MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4386953567 · doi:10.1371/journal.pmed.1004293

Recommendations on data sharing in HIV drug resistance research

2023· article· en· W4386953567 sur OpenAlexaff
Seth Inzaule, Mark J. Siedner, Susan J. Little, Santiago Ávila‐Ríos, Alisen Ayitewala, Ronald J. Bosch, Vincent Cálvez, Francesca Ceccherini‐Silberstein, Charlotte Charpentier, Diane Descamps, Susan H. Eshleman, Joseph Fokam, Lisa M. Frenkel, Ravindra K. Gupta, John P. A. Ioannidis, Pontiano Kaleebu, Rami Kantor, Seble Kassaye, Sergei L. Kosakovsky Pond, Vinie Kouamou, Roger D. Kouyos, Daniel R. Kuritzkes, Richard Lessells, Anne‐Geneviève Marcelin, Lawrence Mbuagbaw, Brian Minalga, Nicaise Ndembi, Richard A. Neher, Roger Paredes, Deenan Pillay, Elliot Raizes, Soo‐Yon Rhee, Douglas D. Richman, Kiat Ruxrungtham, Pardis C. Sabeti, Jonathan Schapiro, Sunee Sirivichayakul, Kim Steegen, Wataru Sugiura, Gert U. van Zyl, Anne‐Mieke Vandamme, Annemarie M. J. Wensing, Joel O. Wertheim, Huldrych F. Günthard, Michael R. Jordan, Robert W. Shafer

Notice bibliographique

RevuePLoS Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensMcMaster UniversityImpact
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCenters for Disease Control and PreventionViiV HealthcareMedical Research CouncilGilead Sciences
Mots-clésDrug resistanceMedicineHIV drug resistanceDrugAntiretroviral drugTransmission (telecommunications)Human immunodeficiency virus (HIV)Intensive care medicineVirologyBiologyViral loadPharmacologyAntiretroviral therapyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

• Human immunodeficiency virus (HIV) drug resistance has implications for antiretroviral treatment strategies and for containing the HIV pandemic because the development of HIV drug resistance leads to the requirement for antiretroviral drugs that may be less effective, less well-tolerated, and more expensive than those used in first-line regimens. • HIV drug resistance studies are designed to determine which HIV mutations are selected by antiretroviral drugs and, in turn, how these mutations affect antiretroviral drug susceptibility and response to future antiretroviral treatment regimens. • Such studies collectively form a vital knowledge base essential for monitoring global HIV drug resistance trends, interpreting HIV genotypic tests, and updating HIV treatment guidelines. • Although HIV drug resistance data are collected in many studies, such data are often not publicly shared, prompting the need to recommend best practices to encourage and standardize HIV drug resistance data sharing. • In contrast to other viruses, sharing HIV sequences from phylogenetic studies of transmission dynamics requires additional precautions as HIV transmission is criminalized in many countries and regions. • Our recommendations are designed to ensure that the data that contribute to HIV drug resistance knowledge will be available without undue hardship to those publishing HIV drug resistance studies and without risk to people living with HIV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,788
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,366
Tête enseignante GPT0,449
Écart entre enseignants0,083 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS MedicineMême sujetHIV/AIDS drug development and treatmentTravaux en français237 207