A new set of international <i>Leptosphaeria maculans</i> isolates as a resource for elucidation of the basis and evolution of blackleg disease on <i>Brassica napus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract A collection of isolates of the fungi Leptosphaeria maculans and L . biglobosa , which cause blackleg disease on Brassica napus (canola/oilseed rape) and other Brassicaceae species, was assembled to represent the global diversity of these pathogens and a resource for international research. The collection consists of 226 isolates (205 L . maculans and 21 L . biglobosa ) from 11 countries. The genomes of all 205 L . maculans isolates were sequenced, and the distribution and identity of avirulence gene alleles were determined based on genotypic information and phenotypic reactions on B . napus lines that hosted specific resistance genes. Whilst the frequencies of some avirulence alleles were consistent across each of the regions, others differed dramatically, potentially reflecting the canola/oilseed rape cultivars grown in those countries. Analyses of the single‐nucleotide polymorphism (SNP) diversity within these L . maculans isolates revealed geographical separation of the populations. This "open access" resource provides a standardized set of isolates that can be used to define the basis for how these fungal pathogens cause disease, and as a tool for discovery of new resistance traits in Brassica species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».