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Enregistrement W4386961589 · doi:10.1111/irv.13201

Lessons learned from identifying clusters of severe acute respiratory infections with influenza sentinel surveillance, Bangladesh, 2009–2020

2023· article· en· W4386961589 sur OpenAlexaff
Md. Ariful Islam, Md Zakiul Hassan, Mohammad Abdul Aleem, Zubair Akhtar, Sukanta Chowdhury, Mustafizur Rahman, Mohammed Ziaur Rahman, Md Kaousar Ahmmed, Syeda Mah‐E‐Muneer, A. S. M. Alamgir, Shah Niaz Rubaid Anwar, Ahmed Nawsher Alam, Tahmina Shirin, Mahmudur Rahman, William W. Davis, Joshua A. Mott, Eduardo Azziz‐Baumgartner, Fahmida Chowdhury

Notice bibliographique

RevueInfluenza and Other Respiratory Viruses · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensCentre for Global Health Research
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clésOutbreakHuman metapneumovirusMedicineCluster (spacecraft)VirologyMetapneumovirusVirusInfluenza A virusInfluenza A virus subtype H5N1Respiratory systemRespiratory tract infectionsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: We explored whether hospital-based surveillance is useful in detecting severe acute respiratory infection (SARI) clusters and how often these events result in outbreak investigation and community mitigation. Methods: During May 2009-December 2020, physicians at 14 sentinel hospitals prospectively identified SARI clusters (i.e., ≥2 SARI cases who developed symptoms ≤10 days of each other and lived <30 min walk or <3 km from each other). Oropharyngeal and nasopharyngeal swabs were tested for influenza and other respiratory viruses by real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (rRT-PCR). We describe the demographic of persons within clusters, laboratory results, and outbreak investigations. Results: Field staff identified 464 clusters comprising 1427 SARI cases (range 0-13 clusters per month). Sixty percent of clusters had three, 23% had two, and 17% had ≥4 cases. Their median age was 2 years (inter-quartile range [IQR] 0.4-25) and 63% were male. Laboratory results were available for the 464 clusters with a median of 9 days (IQR = 6-13 days) after cluster identification. Less than one in five clusters had cases that tested positive for the same virus: respiratory syncytial virus (RSV) in 58 (13%), influenza viruses in 24 (5%), human metapneumovirus (HMPV) in five (1%), human parainfluenza virus (HPIV) in three (0.6%), adenovirus in two (0.4%). While 102/464 (22%) had poultry exposure, none tested positive for influenza A (H5N1) or A (H7N9). None of the 464 clusters led to field deployments for outbreak response. Conclusions: For 11 years, none of the hundreds of identified clusters led to an emergency response. The value of this event-based surveillance might be improved by seeking larger clusters, with stronger epidemiologic ties or decedents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,671
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,227
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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