Development of Polymorphic SSR Markers in Chinese Water Chestnut Based on RAD-seq
Notice bibliographique
Résumé
Chinese water chestnut ( Eleocharis dulcis ) is an important characteristic vegetable that grows in shallow waters. In order to develop simple sequence repeat (SSR) molecular markers for genetics research on Eleocharis dulcis , simplified genome sequencing by restriction-site associated DNA sequencing (RAD-seq), SSR search and primer design were performed. A total of 5039 SSR loci were detected, from which 4 137 pairs of primer were designed. Among them, the proportion of tri-nucleotides motifs was the highest (1 894), accounting for 45.89% of the total loci; followed by di-nucleotide with 1 406, accounting for 34.07%.. A total of 100 pairs of randomly selected primers were verified. 93% of the primers were successfully amplified. To assess the polymorphism of these primers, two varieties of Chinese water chestnuts were used to amplify the SSR marker using 83 pairs of primers. The 83 pairs of primers generated a total of 232 fragments. A total of 128 fragments were polymorphic. 60 pairs of primers out of 83 pairs generated at least one polymorphic band, and the ratio of polymorphic primers was 72.28%. These SSR markers developed from RAD tags were proved to be effective, which will provide a useful tool for genetic diversity research and molecular breeding in Chinese water chestnuts.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».