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Enregistrement W4386998495 · doi:10.1101/2023.09.22.23294942

Radiomic-Based Prediction of Lesion-Specific Systemic Treatment Response in Metastatic Disease

2023· preprint· en· W4386998495 sur OpenAlexaff
Caryn Geady, Farnoosh Abbas‐Aghababazadeh, Andrés Kohan, Scott M. Schuetze, David Shultz, Benjamin Haibe‐Kains

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensVector InstitutePrincess Margaret Cancer CentrePublic Health OntarioOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthSarcoma Alliance for Research through Collaboration
Mots-clésMedicineSystemic therapyDiseaseLesionOncologyInternal medicineRadiologyPathologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Despite sharing the same histologic classification, individual tumors in multi metastatic patients may present with different characteristics and varying sensitivities to anticancer therapies. In this study, we investigate the utility of radiomic biomarkers for prediction of lesion-specific treatment resistance in multi metastatic leiomyosarcoma patients. Using a dataset of n=202 lung metastases (LM) from n=80 patients with 1648 pre-treatment computed tomography (CT) radiomics features and LM progression determined from follow-up CT, we developed a radiomic model to predict the progression of each lesion. Repeat experiments assessed the relative predictive performance across LM volume groups. Lesion-specific radiomic models indicate up to a 4.5-fold increase in predictive capacity compared with a no-skill classifier, with an area under the precision-recall curve of 0.70 for the most precise model (FDR = 0.05). Precision varied by administered drug and LM volume. The effect of LM volume was controlled by removing radiomic features at a volume-correlation coefficient threshold of 0.20. Predicting lesion-specific responses using radiomic features represents a novel strategy by which to assess treatment response that acknowledges biological diversity within metastatic subclones, which could facilitate management strategies involving selective ablation of resistant clones in the setting of systemic therapy. Highlights Intensity values in CT scans and their corresponding spatial distribution convey important information. A model to predict lesion-specific response to systemic treatment using image-derived features is proposed. Up to a 4.5-fold increase in predictive capacity compared to a no-skill classifier was obtained, with AUPRC of 0.70 for the most precise model (FDR = 0.05). Assessing treatment response on a lesion-level acknowledges biological diversity within metastatic subclones, which could facilitate management strategies involving selective ablation of resistant clones in the setting of systemic therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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