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Enregistrement W4387002011

The Past, Present, and Future of the Brain Imaging Data Structure (BIDS).

2024· preprint· en· W4387002011 sur OpenAlexaff
Russell A. Poldrack, Christopher J. Markiewicz, Stefan Appelhoff, Yoni K. Ashar, Tibor Auer, Sylvain Baillet, Shashank Bansal, Leandro Beltrachini, Christian Bénar, Giacomo Bertazzoli, Suyash Bhogawar, Ross Blair, Marta Bortoletto, Mathieu Boudreau, Teon L Brooks, Filippo Maria Castelli, Patricia Clement, Alexander L. Cohen, Julien Cohen‐Adad, Sasha D’Ambrosio, Gilles de Hollander, María de la Iglesia-Vayá, Alejandro de la Vega, Arnaud Delorme, Orrin Devinsky, Dejan Draschkow, Eugene Duff, Elizabeth DuPré, Eric Earl, Oscar Estéban, Franklin Feingold, Guillaume Flandin, Anthony Galassi, Giuseppe Gallitto, Melanie Ganz, Rémi Gau, James Gholam, Satrajit Ghosh, Alessio Giacomel, Ashley Gillman, Padraig Gleeson, Alexandre Gramfort, Samuel Guay, Giacomo Guidali, Yaroslav O. Halchenko, Daniel A. Handwerker, Nell Hardcastle, Peer Herholz, Dora Hermes, Christopher J. Honey, Robert B. Innis, Horea-Ioan Ioanas, Andrew Jahn, Agâh Karakuzu, David B. Keator, Gregory Kiar, Bálint Kincses, Angela R. Laird, Jonathan C. Lau, Alberto Lazari, Jon Haitz Legarreta, Adam Li, Xiangrui Li, Bradley C. Love, Hanzhang Lu, Eleonora Marcantoni, Camille Maumet, Giacomo Mazzamuto, Steven L. Meisler, Mark E. Mikkelsen, Henk Mutsaerts, Thomas E. Nichols, Aki Nikolaidis, Gustav Nilsonne, Guiomar Niso, Martin Nørgaard, Thomas W. Okell, Robert Oostenveld, Eduard Ort, Patrick Park, Mateusz Pawlik, Cyril Pernet, Franco Pestilli, Jan Petr, Christophe Phillips, Jean‐Baptiste Poline, Luca Pollonini, Pradeep Reddy Raamana, Petra Ritter, Gaia Rizzo, Kay A. Robbins, Alexander P. Rockhill, Christine Rogers, Ariel Rokem, Chris Rorden, Alexandre Routier, Jose Manuel Saborit-Torres, Taylor Salo, Michael Schirner, Robert E. Smith, Tamás Spisák, Julia Sprenger, Nicole C. Swann, Martin Szinte, Sylvain Takerkart, Bertrand Thirion, Adam G. Thomas, Sajjad Torabian, Gaël Varoquaux, Bradley Voytek, Julius Welzel, Martin Wilson, Tal Yarkoni, Krzysztof J. Gorgolewski

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversité de MontréalWestern UniversityPolytechnique MontréalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE European Innovation CouncilBerlin Institute of HealthNovo Nordisk FondenNovo NordiskHorizon 2020 Framework ProgrammeDeutsche ForschungsgemeinschaftAgence Nationale de la RechercheNational Institutes of HealthLaura and John Arnold FoundationNational Science Foundation
Mots-clésMetadataModalitiesData scienceComputer scienceNeuroinformaticsRange (aeronautics)Cognitive scienceNeuroscienceWorld Wide WebPsychologySociologyEngineeringSocial science
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Brain Imaging Data Structure (BIDS) is a community-driven standard for the organization of data and metadata from a growing range of neuroscience modalities. This paper is meant as a history of how the standard has developed and grown over time. We outline the principles behind the project, the mechanisms by which it has been extended, and some of the challenges being addressed as it evolves. We also discuss the lessons learned through the project, with the aim of enabling researchers in other domains to learn from the success of BIDS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,064
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,074
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,936
Score d'incertitude au seuil0,337

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0640,074
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0030,012
Communication savante0,0140,030
Science ouverte0,0030,010
Intégrité de la recherche0,0030,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineReproductibilité
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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