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Enregistrement W4387002549 · doi:10.1080/22221751.2023.2263592

Asian Zika virus can acquire generic African-lineage mutations during <i>in utero</i> infection

2023· article· en· W4387002549 sur OpenAlexaff
Ahmad Jawad Sabir, Prince Pal Singh, Ivan Trus, Nguyen Phuong Khanh Le, Uladzimir Karniychuk

Notice bibliographique

RevueEmerging Microbes & Infections · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesCreative Work and Research Committee, Valparaiso University
Mots-clésZika virusIn uteroBiologyVirologyFetusMicrocephalyFlavivirusVirusLineage (genetic)Dengue virusImmunologyPregnancyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Zika virus 2015 epidemic showed an unusual phenotype for human flaviviruses, specifically fetal infection.We previously showed that in utero inoculation with the Asian Zika virus isolated from the human sample causes persistent infection in porcine fetuses.Here, we characterized the evolution of the Asian Zika virus in the fetal brain and placenta.Interestingly, the Asian Zika virus acquired generic African lineage K101R (A408G) and R1609 K (G4932A) mutations during in utero infection.Both African mutations were nonsynonymous and had a high frequency of nearly 100% in the fetal brain.Then, we synthetically generated the wild-type Asian variant and fetal brain-specific variant with generic African-lineage K101R and R1609 K mutations.In mosquito C6/36 cells, but not in human and pig cells, the fetal brain-specific variant showed higher virus loads compared to the Asian wild-type prototype.While in utero infection with both variants caused comparable virus loads in the placenta and amniotic fluids, fetuses injected with the fetal brain-specific variant had the trend to higher virus loads in lymph nodes.Also, introduced K101R and R1609 K mutations were stable and had high nearly 100% frequency at 28 days after in utero inoculation in both directly injected and trans-infected fetuses.These findings evoke concerns because Zika persists in pig herds and mosquitoes on farms in Mexico.It will be essential to identify how persistent in utero infection affects virus evolution and whether in utero-emerged Zika variants have the potential for shedding into the environment, more efficient transmission, and more aggressive infection phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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