Asian Zika virus can acquire generic African-lineage mutations during <i>in utero</i> infection
Notice bibliographique
Résumé
The Zika virus 2015 epidemic showed an unusual phenotype for human flaviviruses, specifically fetal infection.We previously showed that in utero inoculation with the Asian Zika virus isolated from the human sample causes persistent infection in porcine fetuses.Here, we characterized the evolution of the Asian Zika virus in the fetal brain and placenta.Interestingly, the Asian Zika virus acquired generic African lineage K101R (A408G) and R1609 K (G4932A) mutations during in utero infection.Both African mutations were nonsynonymous and had a high frequency of nearly 100% in the fetal brain.Then, we synthetically generated the wild-type Asian variant and fetal brain-specific variant with generic African-lineage K101R and R1609 K mutations.In mosquito C6/36 cells, but not in human and pig cells, the fetal brain-specific variant showed higher virus loads compared to the Asian wild-type prototype.While in utero infection with both variants caused comparable virus loads in the placenta and amniotic fluids, fetuses injected with the fetal brain-specific variant had the trend to higher virus loads in lymph nodes.Also, introduced K101R and R1609 K mutations were stable and had high nearly 100% frequency at 28 days after in utero inoculation in both directly injected and trans-infected fetuses.These findings evoke concerns because Zika persists in pig herds and mosquitoes on farms in Mexico.It will be essential to identify how persistent in utero infection affects virus evolution and whether in utero-emerged Zika variants have the potential for shedding into the environment, more efficient transmission, and more aggressive infection phenotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».