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Enregistrement W4387089443 · doi:10.4049/jimmunol.2300391

Relationship of Heterologous Virus Responses and Outcomes in Hospitalized COVID-19 Patients

2023· article· en· W4387089443 sur OpenAlexaff
Yael Rosenberg‐Hasson, Tyson H. Holmes, Joann Diray‐Arce, Jing Chen, Ryan Kellogg, M Snyder, Patrice M. Becker, Al Ozonoff, Nadine Rouphael, Elaine F. Reed

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésTiterMedicineCohortVirologyVirusLongitudinal studyImmunologyPopulationHeterologousBiologyInternal medicinePathologyEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The clinical trajectory of COVID-19 may be influenced by previous responses to heterologous viruses. We examined the relationship of Abs against different viruses to clinical trajectory groups from the National Institutes of Health IMPACC (Immunophenotyping Assessment in a COVID-19 Cohort) study of hospitalized COVID-19 patients. Whereas initial Ab titers to SARS-CoV-2 tended to be higher with increasing severity (excluding fatal disease), those to seasonal coronaviruses trended in the opposite direction. Initial Ab titers to influenza and parainfluenza viruses also tended to be lower with increasing severity. However, no significant relationship was observed for Abs to other viruses, including measles, CMV, EBV, and respiratory syncytial virus. We hypothesize that some individuals may produce lower or less durable Ab responses to respiratory viruses generally (reflected in lower baseline titers in our study), and that this may carry over into poorer outcomes for COVID-19 (despite high initial SARS-CoV-2 titers). We further looked at longitudinal changes in Ab responses to heterologous viruses, but found little change during the course of acute COVID-19 infection. We saw significant trends with age for Ab levels to many of these viruses, but no difference in longitudinal SARS-CoV-2 titers for those with high versus low seasonal coronavirus titers. We detected no difference in longitudinal SARS-CoV-2 titers for CMV seropositive versus seronegative patients, although there was an overrepresentation of CMV seropositives among the IMPACC cohort, compared with expected frequencies in the United States population. Our results both reinforce findings from other studies and suggest (to our knowledge) new relationships between the response to SARS-CoV-2 and Abs to heterologous viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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