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Enregistrement W4387099259 · doi:10.1038/s43856-023-00361-2

Genetic and clinical variables act synergistically to impact neurodevelopmental outcomes in children with single ventricle heart disease

2023· article· en· W4387099259 sur OpenAlexaff
Thomas A. Miller, Edgar J. Hernández, J. William Gaynor, Mark W. Russell, Jane W. Newburger, Wendy K. Chung, Elizabeth Goldmuntz, James Cnota, Sinai C. Zyblewski, William T. Mahle, Victor Zak, Chitra Ravishankar, Jonathan R. Kaltman, Brian W. McCrindle, Shanelle Clarke, Jodie K. Votava‐Smith, Eric M. Graham, Mike Seed, Nancy A. Rudd, Daniel Bernstein, Teresa M. Lee, Mark Yandell, Martin Tristani‐Firouzi

Notice bibliographique

RevueCommunications Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésHeart diseaseContext (archaeology)EtiologyMedicineCohortDiseaseInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recent large-scale sequencing efforts have shed light on the genetic contribution to the etiology of congenital heart defects (CHD); however, the relative impact of genetics on clinical outcomes remains less understood. Outcomes analyses using genetics are complicated by the intrinsic severity of the CHD lesion and interactions with conditionally dependent clinical variables. METHODS: Bayesian Networks were applied to describe the intertwined relationships between clinical variables, demography, and genetics in a cohort of children with single ventricle CHD. RESULTS: As isolated variables, a damaging genetic variant in a gene related to abnormal heart morphology and prolonged ventilator support following stage I palliative surgery increase the probability of having a low Mental Developmental Index (MDI) score at 14 months of age by 1.9- and 5.8-fold, respectively. However, in combination, these variables act synergistically to further increase the probability of a low MDI score by 10-fold. The absence of a damaging variant in a known syndromic CHD gene and a shorter post-operative ventilator support increase the probability of a normal MDI score 1.7- and 2.4-fold, respectively, but in combination increase the probability of a good outcome by 59-fold. CONCLUSIONS: Our analyses suggest a modest genetic contribution to neurodevelopmental outcomes as isolated variables, similar to known clinical predictors. By contrast, genetic, demographic, and clinical variables interact synergistically to markedly impact clinical outcomes. These findings underscore the importance of capturing and quantifying the impact of damaging genomic variants in the context of multiple, conditionally dependent variables, such as pre- and post-operative factors, and demography.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,333

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,344 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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