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Enregistrement W4387141226 · doi:10.21203/rs.3.rs-3376348/v1

The impact of blood MCP-1 levels on Alzheimer’s disease with genetic variation of UNC5C and NAV3 loci

2023· preprint· en· W4387141226 sur OpenAlexfundno aff
Jinghan Huang, Yixuan Wang, Thor D. Stein, Ting Fang Alvin Ang, Yibo Zhu, Qiushan Tao, Kathryn L. Lunetta, Jesse Mez, Rhoda Au, Lindsay A. Farrer, Wei Qiao Qiu, Xiaoling Zhang

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierNovartis Pharmaceuticals CorporationBioClinicaU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeF. Hoffmann-La RocheBristol-Myers SquibbEli Lilly and CompanyBiogenEisaiAlzheimer's Association
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismGenome-wide association studyAlleleBiologyGenotypeDiseaseGenetic associationFramingham Heart StudyGeneticsMedicineInternal medicineFramingham Risk ScoreGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Previous study shows that monocyte chemoattractant protein-1 (MCP-1), which is implicated in the peripheral proinflammatory cascade and blood-brain barrier (BBB) disruption, modulates the genetic risks of AD in established AD loci. Methods In this study, we hypothesized that blood MCP-1 impacts the AD risk of genetic variants beyond known AD loci. We thus performed a genome-wide association study (GWAS) using the logistic regression via generalized estimating equations (GEE) and the Cox proportional-hazards models to examine the interactive effects between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and blood MCP-1 level on AD in three cohorts: the Framingham Heart Study (FHS), Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) and Religious Orders Study/Memory and Aging Project (ROSMAP). Results We identified SNPs in two genes, neuron navigator 3 ( NAV3 , also named Unc-53 Homolog 3, rs696468) (p < 7.55×10 − 9 ) and Unc-5 Netrin Receptor C ( UNC5C rs72659964) (p < 1.07×10 − 8 ) that showed an association between increasing levels of blood MCP-1 and AD. Elevating blood MCP-1 concentrations increased AD risk and AD pathology in genotypes of NAV3 (rs696468-CC) and UNC5C (rs72659964-AT + TT), but did not influence the other counterpart genotypes of these variants. Conclusions NAV3 and UNC5C are homologs and may increase AD risk through dysregulating the functions of neurite outgrowth and guidance. Overall, the association of risk alleles of NAV3 and UNC5C with AD is enhanced by peripheral MCP-1 level, suggesting that lowering the level of blood MCP-1 may reduce the risk of developing AD for people with these genotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,497

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,408
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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