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Enregistrement W4387209596 · doi:10.1007/s11032-023-01417-w

Development and evaluation of the utility of GenoBaits Peanut 40K for a peanut MAGIC population

2023· article· en· W4387209596 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular Breeding · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePeanut Plant Research Studies
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesKey Technologies Research and Development ProgramNational Key Research and Development Program of ChinaHenan Academy of Agricultural Sciences
Mots-clésBiologyPopulationQuantitative trait locusGenotypingSingle-nucleotide polymorphismGeneticsGenotypeBiotechnologyGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Population and genotype data are essential for genetic mapping. The multi-parent advanced generation intercross (MAGIC) population is a permanent mapping population used for precisely mapping quantitative trait loci. Moreover, genotyping-by-target sequencing (GBTS) is a robust high-throughput genotyping technology characterized by its low cost, flexibility, and limited requirements for information management and support. In this study, an 8-way MAGIC population was constructed using eight elite founder lines. In addition, GenoBaits Peanut 40K was developed and utilized for the constructed MAGIC population. A subset (297 lines) of the MAGIC population at the S2 stage was genotyped using GenoBaits Peanut 40K. Furthermore, these lines and the eight parents were analyzed in terms of pod length, width, area, and perimeter. A total of 27 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were revealed to be significantly associated with peanut pod size-related traits according to a genome-wide association study. The GenoBaits Peanut 40K provided herein and the constructed MAGIC population will be applicable for future research to identify the key genes responsible for important peanut traits. Supplementary Information: The online version contains supplementary material available at 10.1007/s11032-023-01417-w.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,941
Score d'incertitude au seuil0,094

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,122
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle