MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4387221272 · doi:10.1101/2023.09.29.560118

Functional opsin patterning for <i>Drosophila</i> color vision is established through signaling pathways in adjacent object-detection neurons

2023· preprint· en· W4387221272 sur OpenAlexfundno aff
Manabu Kitamata, Yoshiaki Otake, Hideaki Kitagori, Xuanshuo Zhang, Yusuke Maki, Rika Boku, Masato Takeuchi, Hideki Nakagoshi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésOmmatidiumOpsinBiologyCell biologySignal transductionCompound eyeAnatomyRhodopsinBiochemistryOpticsRetinal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Vision is mainly based on two different tasks, object detection and color discrimination through activities of photoreceptor (PR) cells. Drosophila compound eye consists of ∼800 ommatidia. Every ommatidium contains eight PR cells; six outer cells (R1-R6) and two inner cells (R7 and R8) by which object detection and color vision are achieved, respectively. Expression of opsin genes in R7 and R8 is highly coordinated through the instructive signal from R7 to R8, and two major ommatidial subtypes are distributed stochastically; pale type expresses Rh3/Rh5, while yellow type expresses Rh4/Rh6 in R7/R8. The homeodomain protein Defective proventriculus (Dve) is expressed in yellow-type R7 and in six outer PRs, and it is involved in Rh3 repression to specify the yellow-type R7. dve mutant eyes exhibited atypical coupling, Rh3/Rh6 and Rh4/Rh5, indicating that the Dve activity is required for proper opsin coupling. Surprisingly, Dve activity in R1 is required for instructive signal, whereas those in R6 and R7 block the signal. Our results indicate that functional coupling of two different neurons is established through signaling pathways from adjacent neurons that are functionally different. Summary Statement Dve activity is required for proper opsin coupling of two neurons that is established through signaling pathways from adjacent neurons that are functionally different.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetNeurobiology and Insect Physiology Research→Travaux en français237 207→