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Enregistrement W4387230700 · doi:10.3390/v15102031

The International Virus Bioinformatics Meeting 2023

2023· article· en· W4387230700 sur OpenAlexaff
Franziska Hufsky, Ana Abecasis, Artem Babaian, Sebastian Beck, Liam Brierley, Simon Dellicour, Christian Eggeling, Santiago F. Elena, Udo Gieraths, Anh D. Ha, Will Harvey, Terry C. Jones, Kevin Lamkiewicz, Gabriel Lencioni Lovate, Dominik Lücking, Martin Machyna, Luca Nishimura, Maximilian K. Nocke, Bernhard Y. Renard, Shoichi Sakaguchi, Lygeri Sakellaridi, Jannes Spangenberg, Maria Tarradas-Alemany, Sandra Triebel, Yulia A. Vakulenko, Yasas Wijesekara, Fernando Gónzález‐Candelas, Sarah Krautwurst, Alba Pérez‐Cataluña, Walter Randazzo, Glòria Sánchez, Manja Marz

Notice bibliographique

RevueViruses · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesLunar and Planetary InstituteAgencia Estatal de InvestigaciónFundação para a Ciência e a TecnologiaBundesministerium für GesundheitJapan Society for the Promotion of ScienceSeqirusBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDeutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung Halle-Jena-LeipzigMedical Research CouncilRussian Science FoundationBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Science Foundation
Mots-clésMetagenomicsPandemicEvent (particle physics)VirusCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyData scienceBiologyBioinformaticsComputational biologyMedicineComputer scienceInfectious disease (medical specialty)Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 2023 International Virus Bioinformatics Meeting was held in Valencia, Spain, from 24-26 May 2023, attracting approximately 180 participants worldwide. The primary objective of the conference was to establish a dynamic scientific environment conducive to discussion, collaboration, and the generation of novel research ideas. As the first in-person event following the SARS-CoV-2 pandemic, the meeting facilitated highly interactive exchanges among attendees. It served as a pivotal gathering for gaining insights into the current status of virus bioinformatics research and engaging with leading researchers and emerging scientists. The event comprised eight invited talks, 19 contributed talks, and 74 poster presentations across eleven sessions spanning three days. Topics covered included machine learning, bacteriophages, virus discovery, virus classification, virus visualization, viral infection, viromics, molecular epidemiology, phylodynamic analysis, RNA viruses, viral sequence analysis, viral surveillance, and metagenomics. This report provides rewritten abstracts of the presentations, a summary of the key research findings, and highlights shared during the meeting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0090,002
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0040,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0660,046

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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