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Enregistrement W4387244332 · doi:10.1101/2023.09.30.23296382

HPV detection patterns in young women from the PAPCLEAR longitudinal study: implications for HPV screening policies

2023· preprint· en· W4387244332 sur OpenAlexaff
Thomas Bénéteau, Soraya Groc, Carmen Lía Murall, Vanina Boué, Baptiste Elie, Nicolas Tessandier, Claire Bernat, Marine Bonneau, Vincent Foulongne, Christelle Graf, Sophie Grasset, Massilva Rahmoun, Michel Segondy, Vincent Tribout, Jacques Reynes, Christian P. Selinger, Nathalie Boulle, Ignacio G. Bravo, Mircea T. Sofonea, Samuel Alizon

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeHPV infectionHuman papillomavirusDemographyCohortVaccinationVirologyMedicineDuration (music)Cohort studyImmunologyBiologyOncologyInternal medicineCancerCervical cancerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objectives HPV infections are ubiquitous. For most infections, we lose track of the presence of the virus in host in less than three years after the start of infection. The mechanisms regulating the persistence of HPV infection are still partially understood. In this work, we focus on incident HPV detection in young women and we characterise the dynamics of these infections and evaluate the effect of genotype and host socio-economic factors on the duration of HPV detection and time between detection. Methods We investigated human papillomavirus (HPV) genotype detection patterns in 182 young women in Montpellier, France. We relied on SPF 10 -LiPA25 screening assay for the simultaneous de-tection of 25 HPV genotypes. We used survival analysis tools with frailty effects to investigate the contribution of viral and host factors to variations in the time of HPV detectability, time of first incident detection, and time before re-detection. Results Women of the PAPCLEAR cohort experienced numerous positive HPV events, including frequent redetection of the same genotype. We retrieve classical results that HR-genotypes are detected for longer duration than LR-genotypes. HR-genotypes were also more liekly to be detected than LR-genotypes during the follow-up. The number of lifetime sexual partner was strongly associated with increased risk of new positive detection while vaccination was related to a lower risk of displaying incident infections. Covariates related to socio-economic difficulties were associated with longer duration of HPV positivity. Conclusions Young women display numerous event of HPV detection, with frequent codetections of multiple genotypes at the same time and redetection of the same type after periods of no detection. These new detection are almost certainly the result of new acquisition from sexual partners, with little evidence of re-emergence of latent infections. A better characterisation of transient infections might help unveil doubts and misconception on HPV physiopathology, favouring adherence to preventive policies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,069

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,156
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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