Mitochondrial sequence data reveal population structure within <i>Pustulosa pustulosa</i>
Notice bibliographique
Résumé
Unionid mussels are among the most imperiled group of organisms in North America, and Pustulosa pustulosa is a freshwater species with a relatively wide latitudinal distribution that extends from southern Ontario, Canada, to Texas, USA. Considerable morphological and geographic variation in the genus Pustulosa (formerly Cyclonaias) has led to uncertainty over species boundaries, and recent studies have suggested revisions to species-level classifications by synonymizing C. aurea, C. houstonensis, C. mortoni, and C. refulgens with C. pustulosa (currently P. pustulosa). Owing to its wide range and shallow phylogenetic differentiation, we analyzed individuals of P. pustulosa using mitochondrial DNA sequence data under a population genetics framework. We included 496 individuals, which were comprised of 166 samples collected during this study and 330 additional sequences retrieved from GenBank. Pairwise ΦST measures based on ND1 data suggested there may be up to five major geographic groups present within P. pustulosa. Genetic differentiation between regions within Texas was higher compared to populations from the Mississippi and Great Lakes populations, which may reflect differences in historical connectivity. Mitochondrial sequence data also revealed varying demographic histories for each major group suggesting each geographic region has also experienced differential population dynamics in the past. Future surveys should consider exploring variation within species after phylogeographic delimitation has been performed. In this study, we begin to address this need for freshwater mussels via the P. pustulosa system.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».