Does hepatitis delta virus have a preference for hepatitis B virus genotype? A systematic review of the literature
Notice bibliographique
Résumé
Hepatitis delta virus (HDV) is a deficient virus that requires the surface proteins of Hepatitis B virus (HBV) to complete its replication. HDV is thus only found in those already infected with HBV (~5% worldwide). There are eight different HDV genotypes (1-8) and 10 HBV genotypes (A-J), each having fairly distinct geographic distributions. While their pairings may be coincidental based on epidemiological occurrence, some evidence exists regarding possible virologic basis for genotype dominance and patterns. Here we sought to determine which HBV genotype is most often linked with active HDV infection and speculate on whether this may represent a viral 'preference'. Electronic databases with OVID Medline were comprehensively searched for studies published between 1977 and 2022 indexing the word 'genotype' and all permutations of 'HDV' (hepatitis D virus, hepatitis delta, etc.). Primary studies of patient samples reporting genotype data for either or both of HDV and HBV were tabulated. The initial search revealed 419 articles and was narrowed to 133 studies reporting genotype data for either or both HBV and HDV. We limited our search to cases with detectable HDV RNA. These represented over 5800 samples from over 70 countries. Of these, 1947 samples had paired genotype data for both viruses. The most common pairing was HDV-1 with HBV-D, but it remains unclear whether this represents a viral 'preference' or mere co-endemicity of the two viruses. Determining if there is a virologic link between HBV and HDV genotypes may have important implications for emerging HDV and HBV research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,023 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,006 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,017 | 0,021 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».