Selection on Visual Opsin Genes in Diurnal Neotropical Frogs and Loss of the <i>SWS2</i> Opsin in Poison Frogs
Notice bibliographique
Résumé
Amphibians are ideal for studying visual system evolution because their biphasic (aquatic and terrestrial) life history and ecological diversity expose them to a broad range of visual conditions. Here, we evaluate signatures of selection on visual opsin genes across Neotropical anurans and focus on three diurnal clades that are well-known for the concurrence of conspicuous colors and chemical defense (i.e., aposematism): poison frogs (Dendrobatidae), Harlequin toads (Bufonidae: Atelopus), and pumpkin toadlets (Brachycephalidae: Brachycephalus). We found evidence of positive selection on 44 amino acid sites in LWS, SWS1, SWS2, and RH1 opsin genes, of which one in LWS and two in RH1 have been previously identified as spectral tuning sites in other vertebrates. Given that anurans have mostly nocturnal habits, the patterns of selection revealed new sites that might be important in spectral tuning for frogs, potentially for adaptation to diurnal habits and for color-based intraspecific communication. Furthermore, we provide evidence that SWS2, normally expressed in rod cells in frogs and some salamanders, has likely been lost in the ancestor of Dendrobatidae, suggesting that under low-light levels, dendrobatids have inferior wavelength discrimination compared to other frogs. This loss might follow the origin of diurnal activity in dendrobatids and could have implications for their behavior. Our analyses show that assessments of opsin diversification in across taxa could expand our understanding of the role of sensory system evolution in ecological adaptation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».