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Enregistrement W4387338756 · doi:10.1016/j.celrep.2023.113191

Spatiotemporal modeling of chemoresistance evolution in breast tumors uncovers dependencies on SLC38A7 and SLC46A1

2023· article· en· W4387338756 sur OpenAlexafffund
Yannick Audet-Delage, Catherine St‐Louis, Lucía Minarrieta, Shawn McGuirk, Irwin Kurreal, Matthew G. Annis, Arvind Singh Mer, Peter M. Siegel, Julie St‐Pierre

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueMathematical Biology Tumor Growth
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsFondation du cancer du sein du QuébecCanada Foundation for InnovationCompute CanadaMcGill UniversityTerry Fox Research InstituteUniversity of Ottawa
Mots-clésBreast cancerCancer cellCancer researchChemotherapyDrug resistanceIntracellularCancerBiologyDrugMedicinePharmacologyInternal medicineCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In solid tumors, drug concentrations decrease with distance from blood vessels. However, cellular adaptations accompanying the gradated exposure of cancer cells to drugs are largely unknown. Here, we modeled the spatiotemporal changes promoting chemotherapy resistance in breast cancer. Using pairwise cell competition assays at each step during the acquisition of chemoresistance, we reveal an important priming phase that renders cancer cells previously exposed to sublethal drug concentrations refractory to dose escalation. Therapy-resistant cells throughout the concentration gradient display higher expression of the solute carriers SLC38A7 and SLC46A1 and elevated intracellular concentrations of their associated metabolites. Reduced levels of SLC38A7 and SLC46A1 diminish the proliferative potential of cancer cells, and elevated expression of these SLCs in breast tumors from patients correlates with reduced survival. Our work provides mechanistic evidence to support dose-intensive treatment modalities for patients with solid tumors and reveals two members of the SLC family as potential actionable targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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